Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGE6

Atg4b, Cysteine protease ATG4B, mousemouse

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Length 393 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4bQ8BGE6 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Atg4bQ8BGE6 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Atg4bQ8BGE6 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Atg4bQ8BGE6 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Atg4bQ8BGE6 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Atg4bQ8BGE6 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Atg4bQ8BGE6 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Atg4bQ8BGE6 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Atg4bQ8BGE6 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Atg4bQ8BGE6 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Atg4bQ8BGE6 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Atg4bQ8BGE6 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Atg4bQ8BGE6 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Atg4bQ8BGE6 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Atg4bQ8BGE6 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Atg4bQ8BGE6 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Atg4bQ8BGE6 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Atg4bQ8BGE6 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Atg4bQ8BGE6 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Atg4bQ8BGE6 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Atg4bQ8BGE6 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Atg4bQ8BGE6 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Atg4bQ8BGE6 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Atg4bQ8BGE6 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Atg4bQ8BGE6 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Atg4bQ8BGE6 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Atg4bQ8BGE6 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Atg4bQ8BGE6 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Atg4bQ8BGE6 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Atg4bQ8BGE6 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Atg4bQ8BGE6 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Atg4bQ8BGE6 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Atg4bQ8BGE6 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Atg4bQ8BGE6 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Atg4bQ8BGE6 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Atg4bQ8BGE6 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Atg4bQ8BGE6 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Atg4bQ8BGE6 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Atg4bQ8BGE6 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Atg4bQ8BGE6 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Atg4bQ8BGE6 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Atg4bQ8BGE6 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Atg4bQ8BGE6 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Atg4bQ8BGE6 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Atg4bQ8BGE6 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Atg4bQ8BGE6 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Atg4bQ8BGE6 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Atg4bQ8BGE6 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Atg4bQ8BGE6 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Atg4bQ8BGE6 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Atg4bQ8BGE6 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Atg4bQ8BGE6 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Atg4bQ8BGE6 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Atg4bQ8BGE6 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Atg4bQ8BGE6 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Atg4bQ8BGE6 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Atg4bQ8BGE6 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Atg4bQ8BGE6 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Atg4bQ8BGE6 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Atg4bQ8BGE6 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Atg4bQ8BGE6 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Atg4bQ8BGE6 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Atg4bQ8BGE6 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Atg4bQ8BGE6 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Atg4bQ8BGE6 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Atg4bQ8BGE6 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Atg4bQ8BGE6 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Atg4bQ8BGE6 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Atg4bQ8BGE6 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Atg4bQ8BGE6 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Atg4bQ8BGE6 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Atg4bQ8BGE6 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Atg4bQ8BGE6 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Atg4bQ8BGE6 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Atg4bQ8BGE6 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Atg4bQ8BGE6 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Atg4bQ8BGE6 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Atg4bQ8BGE6 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Atg4bQ8BGE6 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Atg4bQ8BGE6 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Atg4bQ8BGE6 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Atg4bQ8BGE6 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Atg4bQ8BGE6 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Atg4bQ8BGE6 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Atg4bQ8BGE6 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Atg4bQ8BGE6 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Atg4bQ8BGE6 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Atg4bQ8BGE6 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Atg4bQ8BGE6 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Atg4bQ8BGE6 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Atg4bQ8BGE6 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Atg4bQ8BGE6 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Atg4bQ8BGE6 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Atg4bQ8BGE6 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Atg4bQ8BGE6 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Atg4bQ8BGE6 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Atg4bQ8BGE6 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Atg4bQ8BGE6 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Atg4bQ8BGE6 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Atg4bQ8BGE6 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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