Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF0

Dsg1c, Desmoglein-1-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1cQ7TSF0 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.3 ms