Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMV1

Rnf139, E3 ubiquitin-protein ligase RNF139, mousemouse

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Length 668 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf139Q7TMV1 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
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Rnf139Q7TMV1 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf139Q7TMV1 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf139Q7TMV1 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf139Q7TMV1 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf139Q7TMV1 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf139Q7TMV1 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf139Q7TMV1 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf139Q7TMV1 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf139Q7TMV1 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf139Q7TMV1 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf139Q7TMV1 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf139Q7TMV1 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf139Q7TMV1 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf139Q7TMV1 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf139Q7TMV1 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf139Q7TMV1 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Rnf139Q7TMV1 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf139Q7TMV1 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Rnf139Q7TMV1 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf139Q7TMV1 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf139Q7TMV1 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf139Q7TMV1 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Rnf139Q7TMV1 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf139Q7TMV1 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf139Q7TMV1 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Rnf139Q7TMV1 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf139Q7TMV1 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Rnf139Q7TMV1 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf139Q7TMV1 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Rnf139Q7TMV1 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Rnf139Q7TMV1 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf139Q7TMV1 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf139Q7TMV1 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf139Q7TMV1 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf139Q7TMV1 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Rnf139Q7TMV1 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf139Q7TMV1 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf139Q7TMV1 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf139Q7TMV1 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf139Q7TMV1 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf139Q7TMV1 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf139Q7TMV1 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf139Q7TMV1 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf139Q7TMV1 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf139Q7TMV1 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf139Q7TMV1 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf139Q7TMV1 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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