Protein–RNA interactions for Protein: Q78S06

Sys1, Protein SYS1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sys1Q78S06 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sys1Q78S06 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sys1Q78S06 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sys1Q78S06 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sys1Q78S06 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sys1Q78S06 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sys1Q78S06 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sys1Q78S06 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sys1Q78S06 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Sys1Q78S06 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sys1Q78S06 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Sys1Q78S06 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sys1Q78S06 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sys1Q78S06 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sys1Q78S06 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sys1Q78S06 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sys1Q78S06 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sys1Q78S06 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Sys1Q78S06 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sys1Q78S06 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sys1Q78S06 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Sys1Q78S06 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sys1Q78S06 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sys1Q78S06 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Sys1Q78S06 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Sys1Q78S06 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sys1Q78S06 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Sys1Q78S06 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Sys1Q78S06 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sys1Q78S06 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Sys1Q78S06 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sys1Q78S06 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sys1Q78S06 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sys1Q78S06 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sys1Q78S06 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sys1Q78S06 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Sys1Q78S06 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sys1Q78S06 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sys1Q78S06 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sys1Q78S06 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sys1Q78S06 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sys1Q78S06 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sys1Q78S06 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sys1Q78S06 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sys1Q78S06 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sys1Q78S06 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sys1Q78S06 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sys1Q78S06 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sys1Q78S06 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sys1Q78S06 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sys1Q78S06 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sys1Q78S06 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sys1Q78S06 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sys1Q78S06 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sys1Q78S06 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sys1Q78S06 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sys1Q78S06 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sys1Q78S06 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sys1Q78S06 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sys1Q78S06 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sys1Q78S06 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sys1Q78S06 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sys1Q78S06 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Sys1Q78S06 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sys1Q78S06 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sys1Q78S06 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sys1Q78S06 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sys1Q78S06 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sys1Q78S06 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sys1Q78S06 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sys1Q78S06 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sys1Q78S06 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sys1Q78S06 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Sys1Q78S06 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sys1Q78S06 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sys1Q78S06 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Sys1Q78S06 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sys1Q78S06 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sys1Q78S06 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sys1Q78S06 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sys1Q78S06 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sys1Q78S06 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sys1Q78S06 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sys1Q78S06 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sys1Q78S06 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sys1Q78S06 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sys1Q78S06 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sys1Q78S06 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Sys1Q78S06 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sys1Q78S06 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sys1Q78S06 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sys1Q78S06 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sys1Q78S06 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sys1Q78S06 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sys1Q78S06 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sys1Q78S06 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sys1Q78S06 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sys1Q78S06 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sys1Q78S06 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sys1Q78S06 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms