Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc88cQ6VGS5 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Ccdc88cQ6VGS5 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Ccdc88cQ6VGS5 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Ccdc88cQ6VGS5 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc88cQ6VGS5 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc88cQ6VGS5 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc88cQ6VGS5 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc88cQ6VGS5 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc88cQ6VGS5 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc88cQ6VGS5 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc88cQ6VGS5 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc88cQ6VGS5 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc88cQ6VGS5 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc88cQ6VGS5 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc88cQ6VGS5 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc88cQ6VGS5 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc88cQ6VGS5 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc88cQ6VGS5 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc88cQ6VGS5 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc88cQ6VGS5 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc88cQ6VGS5 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc88cQ6VGS5 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc88cQ6VGS5 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc88cQ6VGS5 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc88cQ6VGS5 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc88cQ6VGS5 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc88cQ6VGS5 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc88cQ6VGS5 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc88cQ6VGS5 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc88cQ6VGS5 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc88cQ6VGS5 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc88cQ6VGS5 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc88cQ6VGS5 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc88cQ6VGS5 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc88cQ6VGS5 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc88cQ6VGS5 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc88cQ6VGS5 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc88cQ6VGS5 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc88cQ6VGS5 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc88cQ6VGS5 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc88cQ6VGS5 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc88cQ6VGS5 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc88cQ6VGS5 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc88cQ6VGS5 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc88cQ6VGS5 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc88cQ6VGS5 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc88cQ6VGS5 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc88cQ6VGS5 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc88cQ6VGS5 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc88cQ6VGS5 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc88cQ6VGS5 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc88cQ6VGS5 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc88cQ6VGS5 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc88cQ6VGS5 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc88cQ6VGS5 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc88cQ6VGS5 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc88cQ6VGS5 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc88cQ6VGS5 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc88cQ6VGS5 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc88cQ6VGS5 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc88cQ6VGS5 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc88cQ6VGS5 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc88cQ6VGS5 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc88cQ6VGS5 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc88cQ6VGS5 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc88cQ6VGS5 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc88cQ6VGS5 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc88cQ6VGS5 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc88cQ6VGS5 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc88cQ6VGS5 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc88cQ6VGS5 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc88cQ6VGS5 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc88cQ6VGS5 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc88cQ6VGS5 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc88cQ6VGS5 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc88cQ6VGS5 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc88cQ6VGS5 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc88cQ6VGS5 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc88cQ6VGS5 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc88cQ6VGS5 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc88cQ6VGS5 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc88cQ6VGS5 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc88cQ6VGS5 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc88cQ6VGS5 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc88cQ6VGS5 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc88cQ6VGS5 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc88cQ6VGS5 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc88cQ6VGS5 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc88cQ6VGS5 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc88cQ6VGS5 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc88cQ6VGS5 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc88cQ6VGS5 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms