Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8I4

Pcnp, PEST proteolytic signal-containing nuclear protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcnpQ6P8I4 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PcnpQ6P8I4 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PcnpQ6P8I4 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PcnpQ6P8I4 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
PcnpQ6P8I4 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PcnpQ6P8I4 Syn2-202ENSMUST00000169345 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PcnpQ6P8I4 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PcnpQ6P8I4 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PcnpQ6P8I4 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PcnpQ6P8I4 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PcnpQ6P8I4 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PcnpQ6P8I4 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PcnpQ6P8I4 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PcnpQ6P8I4 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
PcnpQ6P8I4 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PcnpQ6P8I4 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
PcnpQ6P8I4 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
PcnpQ6P8I4 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
PcnpQ6P8I4 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
PcnpQ6P8I4 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PcnpQ6P8I4 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
PcnpQ6P8I4 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PcnpQ6P8I4 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PcnpQ6P8I4 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PcnpQ6P8I4 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PcnpQ6P8I4 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PcnpQ6P8I4 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PcnpQ6P8I4 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PcnpQ6P8I4 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PcnpQ6P8I4 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PcnpQ6P8I4 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PcnpQ6P8I4 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PcnpQ6P8I4 Ppargc1b-201ENSMUST00000063307 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PcnpQ6P8I4 Srsf6-203ENSMUST00000130411 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PcnpQ6P8I4 Sp6-201ENSMUST00000047997 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PcnpQ6P8I4 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PcnpQ6P8I4 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PcnpQ6P8I4 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PcnpQ6P8I4 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PcnpQ6P8I4 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PcnpQ6P8I4 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PcnpQ6P8I4 Chrng-201ENSMUST00000027470 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PcnpQ6P8I4 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PcnpQ6P8I4 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PcnpQ6P8I4 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PcnpQ6P8I4 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PcnpQ6P8I4 Ptpru-202ENSMUST00000097860 3365 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PcnpQ6P8I4 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PcnpQ6P8I4 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PcnpQ6P8I4 Ptpn11-201ENSMUST00000054547 5535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PcnpQ6P8I4 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
PcnpQ6P8I4 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PcnpQ6P8I4 Rnf40-201ENSMUST00000033088 3906 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PcnpQ6P8I4 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
PcnpQ6P8I4 Itgal-204ENSMUST00000120857 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PcnpQ6P8I4 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PcnpQ6P8I4 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
PcnpQ6P8I4 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
PcnpQ6P8I4 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PcnpQ6P8I4 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PcnpQ6P8I4 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PcnpQ6P8I4 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
PcnpQ6P8I4 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PcnpQ6P8I4 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PcnpQ6P8I4 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PcnpQ6P8I4 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PcnpQ6P8I4 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PcnpQ6P8I4 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
PcnpQ6P8I4 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PcnpQ6P8I4 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PcnpQ6P8I4 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PcnpQ6P8I4 Tdrd3-202ENSMUST00000168275 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PcnpQ6P8I4 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PcnpQ6P8I4 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PcnpQ6P8I4 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PcnpQ6P8I4 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PcnpQ6P8I4 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
PcnpQ6P8I4 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
PcnpQ6P8I4 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
PcnpQ6P8I4 Scml2-206ENSMUST00000112345 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
PcnpQ6P8I4 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
PcnpQ6P8I4 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
PcnpQ6P8I4 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
PcnpQ6P8I4 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
PcnpQ6P8I4 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
PcnpQ6P8I4 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
PcnpQ6P8I4 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
PcnpQ6P8I4 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
PcnpQ6P8I4 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PcnpQ6P8I4 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PcnpQ6P8I4 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PcnpQ6P8I4 Tle3-202ENSMUST00000159050 2304 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PcnpQ6P8I4 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PcnpQ6P8I4 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PcnpQ6P8I4 Casc1-203ENSMUST00000111728 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PcnpQ6P8I4 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PcnpQ6P8I4 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PcnpQ6P8I4 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PcnpQ6P8I4 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PcnpQ6P8I4 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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