Protein–RNA interactions for Protein: Q6DIC0

Smarca2, Probable global transcription activator SNF2L2, mousemouse

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Length 1,577 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca2Q6DIC0 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Smarca2Q6DIC0 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Smarca2Q6DIC0 Krtap4-9-201ENSMUST00000105059 1059 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Smarca2Q6DIC0 Gm12783-201ENSMUST00000121425 397 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Smarca2Q6DIC0 Gm15409-201ENSMUST00000135240 520 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Smarca2Q6DIC0 Gm14154-201ENSMUST00000142642 579 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Smarca2Q6DIC0 Iqcf3-202ENSMUST00000186668 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Smarca2Q6DIC0 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Smarca2Q6DIC0 1700001K19Rik-201ENSMUST00000070659 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Smarca2Q6DIC0 Olfr1047-201ENSMUST00000099901 960 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Smarca2Q6DIC0 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Smarca2Q6DIC0 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Smarca2Q6DIC0 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Smarca2Q6DIC0 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Smarca2Q6DIC0 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Smarca2Q6DIC0 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Smarca2Q6DIC0 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Smarca2Q6DIC0 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Smarca2Q6DIC0 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Smarca2Q6DIC0 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Smarca2Q6DIC0 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Smarca2Q6DIC0 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Smarca2Q6DIC0 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Smarca2Q6DIC0 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Smarca2Q6DIC0 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Smarca2Q6DIC0 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Smarca2Q6DIC0 Gad1-207ENSMUST00000148210 1021 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Smarca2Q6DIC0 Gm16081-201ENSMUST00000155992 684 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Smarca2Q6DIC0 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Smarca2Q6DIC0 Gm37013-201ENSMUST00000194544 313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Smarca2Q6DIC0 Mgp-201ENSMUST00000032342 617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Smarca2Q6DIC0 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Smarca2Q6DIC0 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Smarca2Q6DIC0 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Smarca2Q6DIC0 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Smarca2Q6DIC0 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Smarca2Q6DIC0 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Smarca2Q6DIC0 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Smarca2Q6DIC0 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Smarca2Q6DIC0 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Smarca2Q6DIC0 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Smarca2Q6DIC0 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Smarca2Q6DIC0 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Smarca2Q6DIC0 Rnf133-202ENSMUST00000115354 1333 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Smarca2Q6DIC0 Rhox3d-ps-201ENSMUST00000119181 825 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Smarca2Q6DIC0 Gm14236-201ENSMUST00000142374 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Smarca2Q6DIC0 Smim20-201ENSMUST00000147148 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Smarca2Q6DIC0 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Smarca2Q6DIC0 Gm7137-201ENSMUST00000180161 711 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Smarca2Q6DIC0 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Smarca2Q6DIC0 Mpv17-206ENSMUST00000201353 846 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Smarca2Q6DIC0 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Smarca2Q6DIC0 CT030653.1-201ENSMUST00000224382 1279 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Smarca2Q6DIC0 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Smarca2Q6DIC0 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Smarca2Q6DIC0 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Smarca2Q6DIC0 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Smarca2Q6DIC0 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Smarca2Q6DIC0 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Smarca2Q6DIC0 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Smarca2Q6DIC0 Gm11979-201ENSMUST00000119629 743 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Smarca2Q6DIC0 Spdye4a-202ENSMUST00000160502 1245 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Smarca2Q6DIC0 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Smarca2Q6DIC0 2010109P13Rik-201ENSMUST00000204605 392 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Smarca2Q6DIC0 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Smarca2Q6DIC0 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Smarca2Q6DIC0 Gm9661-201ENSMUST00000221611 1122 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Smarca2Q6DIC0 Dydc2-201ENSMUST00000022316 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Smarca2Q6DIC0 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Smarca2Q6DIC0 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Smarca2Q6DIC0 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Smarca2Q6DIC0 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Smarca2Q6DIC0 Llph-201ENSMUST00000020444 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Smarca2Q6DIC0 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Smarca2Q6DIC0 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Smarca2Q6DIC0 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Smarca2Q6DIC0 Capzb-201ENSMUST00000030518 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Smarca2Q6DIC0 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Smarca2Q6DIC0 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Smarca2Q6DIC0 Catsper3-201ENSMUST00000021961 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Smarca2Q6DIC0 Gm14942-201ENSMUST00000119642 336 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Smarca2Q6DIC0 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Smarca2Q6DIC0 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Smarca2Q6DIC0 Rpl9-ps7-201ENSMUST00000140507 579 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Smarca2Q6DIC0 Asgr1-205ENSMUST00000146411 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Smarca2Q6DIC0 D5Ertd615e-203ENSMUST00000198493 1032 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Smarca2Q6DIC0 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Smarca2Q6DIC0 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Smarca2Q6DIC0 Rpl9-ps4-201ENSMUST00000075549 579 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Smarca2Q6DIC0 Gm5451-201ENSMUST00000080545 579 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Smarca2Q6DIC0 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Smarca2Q6DIC0 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Smarca2Q6DIC0 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Smarca2Q6DIC0 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Smarca2Q6DIC0 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Smarca2Q6DIC0 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Smarca2Q6DIC0 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Smarca2Q6DIC0 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Smarca2Q6DIC0 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Smarca2Q6DIC0 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
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