Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS0

Pdzrn3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, mousemouse

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Length 1,063 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzrn3Q69ZS0 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
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Pdzrn3Q69ZS0 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdzrn3Q69ZS0 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdzrn3Q69ZS0 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdzrn3Q69ZS0 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
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Pdzrn3Q69ZS0 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
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Pdzrn3Q69ZS0 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
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Pdzrn3Q69ZS0 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
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Pdzrn3Q69ZS0 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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Pdzrn3Q69ZS0 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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