Protein–RNA interactions for Protein: Q68FE2

Atg9a, Autophagy-related protein 9A, mousemouse

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Length 551 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9aQ68FE2 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atg9aQ68FE2 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Atg9aQ68FE2 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atg9aQ68FE2 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Atg9aQ68FE2 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atg9aQ68FE2 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atg9aQ68FE2 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atg9aQ68FE2 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Atg9aQ68FE2 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Atg9aQ68FE2 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Atg9aQ68FE2 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Atg9aQ68FE2 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atg9aQ68FE2 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Atg9aQ68FE2 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Atg9aQ68FE2 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atg9aQ68FE2 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Atg9aQ68FE2 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atg9aQ68FE2 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atg9aQ68FE2 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atg9aQ68FE2 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atg9aQ68FE2 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atg9aQ68FE2 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atg9aQ68FE2 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atg9aQ68FE2 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atg9aQ68FE2 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Atg9aQ68FE2 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Atg9aQ68FE2 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Atg9aQ68FE2 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atg9aQ68FE2 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Atg9aQ68FE2 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Atg9aQ68FE2 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Atg9aQ68FE2 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Atg9aQ68FE2 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Atg9aQ68FE2 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Atg9aQ68FE2 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Atg9aQ68FE2 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Atg9aQ68FE2 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Atg9aQ68FE2 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Atg9aQ68FE2 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atg9aQ68FE2 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Atg9aQ68FE2 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Atg9aQ68FE2 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atg9aQ68FE2 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atg9aQ68FE2 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atg9aQ68FE2 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atg9aQ68FE2 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Atg9aQ68FE2 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Atg9aQ68FE2 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Atg9aQ68FE2 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Atg9aQ68FE2 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Atg9aQ68FE2 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Atg9aQ68FE2 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Atg9aQ68FE2 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atg9aQ68FE2 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atg9aQ68FE2 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atg9aQ68FE2 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atg9aQ68FE2 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atg9aQ68FE2 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atg9aQ68FE2 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atg9aQ68FE2 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atg9aQ68FE2 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Atg9aQ68FE2 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atg9aQ68FE2 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atg9aQ68FE2 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Atg9aQ68FE2 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atg9aQ68FE2 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Atg9aQ68FE2 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atg9aQ68FE2 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atg9aQ68FE2 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atg9aQ68FE2 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atg9aQ68FE2 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Atg9aQ68FE2 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atg9aQ68FE2 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atg9aQ68FE2 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atg9aQ68FE2 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Atg9aQ68FE2 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atg9aQ68FE2 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atg9aQ68FE2 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atg9aQ68FE2 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atg9aQ68FE2 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Atg9aQ68FE2 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atg9aQ68FE2 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atg9aQ68FE2 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atg9aQ68FE2 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atg9aQ68FE2 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atg9aQ68FE2 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Atg9aQ68FE2 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Atg9aQ68FE2 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Atg9aQ68FE2 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Atg9aQ68FE2 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Atg9aQ68FE2 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atg9aQ68FE2 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atg9aQ68FE2 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atg9aQ68FE2 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atg9aQ68FE2 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atg9aQ68FE2 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atg9aQ68FE2 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atg9aQ68FE2 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Atg9aQ68FE2 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Atg9aQ68FE2 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
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