Protein–RNA interactions for Protein: Q62388

Atm, Serine-protein kinase ATM, mousemouse

Predictions only

Length 3,066 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtmQ62388 Ung-203ENSMUST00000112275 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
AtmQ62388 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
AtmQ62388 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
AtmQ62388 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
AtmQ62388 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
AtmQ62388 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
AtmQ62388 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
AtmQ62388 Gm21759-201ENSMUST00000178345 1828 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
AtmQ62388 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
AtmQ62388 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
AtmQ62388 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
AtmQ62388 BC106175-202ENSMUST00000219344 1213 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
AtmQ62388 Olfr1339-201ENSMUST00000094832 948 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
AtmQ62388 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
AtmQ62388 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
AtmQ62388 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
AtmQ62388 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
AtmQ62388 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
AtmQ62388 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
AtmQ62388 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
AtmQ62388 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
AtmQ62388 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
AtmQ62388 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
AtmQ62388 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
AtmQ62388 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
AtmQ62388 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
AtmQ62388 Defa-ps17-201ENSMUST00000121849 171 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
AtmQ62388 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
AtmQ62388 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
AtmQ62388 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
AtmQ62388 1700011B04Rik-204ENSMUST00000220859 422 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
AtmQ62388 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
AtmQ62388 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
AtmQ62388 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
AtmQ62388 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
AtmQ62388 Sec13-201ENSMUST00000032440 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
AtmQ62388 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
AtmQ62388 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
AtmQ62388 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
AtmQ62388 H2-Bl-203ENSMUST00000183999 358 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
AtmQ62388 Eef1b2-209ENSMUST00000188524 681 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
AtmQ62388 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
AtmQ62388 1700086D15Rik-201ENSMUST00000020855 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
AtmQ62388 Gm45310-201ENSMUST00000210436 275 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
AtmQ62388 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
AtmQ62388 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
AtmQ62388 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
AtmQ62388 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
AtmQ62388 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
AtmQ62388 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
AtmQ62388 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
AtmQ62388 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
AtmQ62388 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
AtmQ62388 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
AtmQ62388 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
AtmQ62388 Opn1mw-202ENSMUST00000101457 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
AtmQ62388 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
AtmQ62388 1700008A23Rik-201ENSMUST00000191694 691 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
AtmQ62388 AC136376.2-201ENSMUST00000228819 490 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
AtmQ62388 Olfr284-201ENSMUST00000063289 918 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
AtmQ62388 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
AtmQ62388 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
AtmQ62388 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
AtmQ62388 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
AtmQ62388 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
AtmQ62388 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
AtmQ62388 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
AtmQ62388 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
AtmQ62388 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
AtmQ62388 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
AtmQ62388 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
AtmQ62388 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC11.58□□□□□ -0.55
AtmQ62388 Gm15524-201ENSMUST00000159874 463 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.55
AtmQ62388 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
AtmQ62388 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC11.58□□□□□ -0.55
AtmQ62388 4933430L12Rik-201ENSMUST00000206788 1194 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
AtmQ62388 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
AtmQ62388 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
AtmQ62388 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.55
AtmQ62388 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
AtmQ62388 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.55
AtmQ62388 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
AtmQ62388 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
AtmQ62388 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
AtmQ62388 Mrps23-201ENSMUST00000024486 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
AtmQ62388 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
AtmQ62388 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
AtmQ62388 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
AtmQ62388 Tff2-201ENSMUST00000024826 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
AtmQ62388 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
AtmQ62388 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
AtmQ62388 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
AtmQ62388 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
AtmQ62388 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
AtmQ62388 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
AtmQ62388 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
AtmQ62388 Harbi1-202ENSMUST00000111322 1316 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
AtmQ62388 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
AtmQ62388 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
AtmQ62388 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
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