Protein–RNA interactions for Protein: Q61398

Pcolce, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcolceQ61398 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
PcolceQ61398 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PcolceQ61398 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PcolceQ61398 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PcolceQ61398 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PcolceQ61398 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PcolceQ61398 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PcolceQ61398 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PcolceQ61398 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PcolceQ61398 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PcolceQ61398 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PcolceQ61398 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
PcolceQ61398 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
PcolceQ61398 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
PcolceQ61398 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
PcolceQ61398 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
PcolceQ61398 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
PcolceQ61398 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
PcolceQ61398 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
PcolceQ61398 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
PcolceQ61398 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
PcolceQ61398 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
PcolceQ61398 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
PcolceQ61398 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
PcolceQ61398 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
PcolceQ61398 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
PcolceQ61398 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
PcolceQ61398 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
PcolceQ61398 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
PcolceQ61398 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
PcolceQ61398 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
PcolceQ61398 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
PcolceQ61398 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
PcolceQ61398 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
PcolceQ61398 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
PcolceQ61398 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
PcolceQ61398 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
PcolceQ61398 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
PcolceQ61398 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
PcolceQ61398 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
PcolceQ61398 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
PcolceQ61398 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
PcolceQ61398 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
PcolceQ61398 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
PcolceQ61398 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
PcolceQ61398 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
PcolceQ61398 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
PcolceQ61398 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
PcolceQ61398 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
PcolceQ61398 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
PcolceQ61398 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
PcolceQ61398 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
PcolceQ61398 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
PcolceQ61398 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
PcolceQ61398 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
PcolceQ61398 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
PcolceQ61398 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
PcolceQ61398 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
PcolceQ61398 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
PcolceQ61398 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
PcolceQ61398 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
PcolceQ61398 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
PcolceQ61398 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
PcolceQ61398 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
PcolceQ61398 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
PcolceQ61398 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
PcolceQ61398 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
PcolceQ61398 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
PcolceQ61398 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
PcolceQ61398 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
PcolceQ61398 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
PcolceQ61398 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
PcolceQ61398 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
PcolceQ61398 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
PcolceQ61398 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
PcolceQ61398 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
PcolceQ61398 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
PcolceQ61398 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
PcolceQ61398 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
PcolceQ61398 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
PcolceQ61398 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
PcolceQ61398 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
PcolceQ61398 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
PcolceQ61398 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
PcolceQ61398 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
PcolceQ61398 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
PcolceQ61398 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
PcolceQ61398 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
PcolceQ61398 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
PcolceQ61398 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
PcolceQ61398 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
PcolceQ61398 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
PcolceQ61398 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
PcolceQ61398 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
PcolceQ61398 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
PcolceQ61398 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
PcolceQ61398 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
PcolceQ61398 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
PcolceQ61398 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
PcolceQ61398 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms