Protein–RNA interactions for Protein: Q60809

Cnot7, CCR4-NOT transcription complex subunit 7, mousemouse

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Length 285 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot7Q60809 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Cnot7Q60809 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cnot7Q60809 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cnot7Q60809 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cnot7Q60809 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cnot7Q60809 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Cnot7Q60809 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cnot7Q60809 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cnot7Q60809 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cnot7Q60809 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cnot7Q60809 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cnot7Q60809 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cnot7Q60809 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cnot7Q60809 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Cnot7Q60809 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Cnot7Q60809 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cnot7Q60809 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cnot7Q60809 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cnot7Q60809 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cnot7Q60809 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Cnot7Q60809 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cnot7Q60809 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Cnot7Q60809 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Cnot7Q60809 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cnot7Q60809 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Cnot7Q60809 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Cnot7Q60809 AC159462.1-201ENSMUST00000214822 687 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Cnot7Q60809 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cnot7Q60809 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cnot7Q60809 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cnot7Q60809 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cnot7Q60809 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cnot7Q60809 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cnot7Q60809 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cnot7Q60809 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cnot7Q60809 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Cnot7Q60809 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnot7Q60809 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnot7Q60809 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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