Protein–RNA interactions for Protein: Q60692

Psmb6, Proteasome subunit beta type-6, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb6Q60692 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Psmb6Q60692 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Psmb6Q60692 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Psmb6Q60692 Pitpnm2os2-203ENSMUST00000198466 2467 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Psmb6Q60692 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Psmb6Q60692 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Psmb6Q60692 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Psmb6Q60692 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Psmb6Q60692 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Psmb6Q60692 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Psmb6Q60692 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Psmb6Q60692 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Psmb6Q60692 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Psmb6Q60692 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Psmb6Q60692 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Psmb6Q60692 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Psmb6Q60692 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Psmb6Q60692 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Psmb6Q60692 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Psmb6Q60692 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Psmb6Q60692 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Psmb6Q60692 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Psmb6Q60692 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Psmb6Q60692 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Psmb6Q60692 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Psmb6Q60692 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Psmb6Q60692 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Psmb6Q60692 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Psmb6Q60692 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Psmb6Q60692 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Psmb6Q60692 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Psmb6Q60692 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Psmb6Q60692 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Psmb6Q60692 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Psmb6Q60692 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Psmb6Q60692 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Psmb6Q60692 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Psmb6Q60692 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Psmb6Q60692 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Psmb6Q60692 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Psmb6Q60692 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Psmb6Q60692 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Psmb6Q60692 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Psmb6Q60692 Trim61-201ENSMUST00000078409 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Psmb6Q60692 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Psmb6Q60692 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Psmb6Q60692 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Psmb6Q60692 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Psmb6Q60692 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Psmb6Q60692 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Psmb6Q60692 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Psmb6Q60692 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Psmb6Q60692 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Psmb6Q60692 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Psmb6Q60692 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Psmb6Q60692 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Psmb6Q60692 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Psmb6Q60692 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Psmb6Q60692 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Psmb6Q60692 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Psmb6Q60692 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Psmb6Q60692 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Psmb6Q60692 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Psmb6Q60692 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Psmb6Q60692 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Psmb6Q60692 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Psmb6Q60692 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Psmb6Q60692 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Psmb6Q60692 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Psmb6Q60692 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Psmb6Q60692 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Psmb6Q60692 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Psmb6Q60692 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Psmb6Q60692 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Psmb6Q60692 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Psmb6Q60692 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Psmb6Q60692 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Psmb6Q60692 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Psmb6Q60692 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Psmb6Q60692 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Psmb6Q60692 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Psmb6Q60692 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Psmb6Q60692 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Psmb6Q60692 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Psmb6Q60692 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Psmb6Q60692 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Psmb6Q60692 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Psmb6Q60692 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Psmb6Q60692 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Psmb6Q60692 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Psmb6Q60692 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Psmb6Q60692 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Psmb6Q60692 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Psmb6Q60692 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Psmb6Q60692 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Psmb6Q60692 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Psmb6Q60692 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Psmb6Q60692 CT009713.5-203ENSMUST00000224218 2079 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Psmb6Q60692 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Psmb6Q60692 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms