Protein–RNA interactions for Protein: Q60598

Cttn, Src substrate cortactin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CttnQ60598 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CttnQ60598 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CttnQ60598 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CttnQ60598 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CttnQ60598 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CttnQ60598 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CttnQ60598 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CttnQ60598 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CttnQ60598 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CttnQ60598 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CttnQ60598 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CttnQ60598 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CttnQ60598 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CttnQ60598 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CttnQ60598 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CttnQ60598 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CttnQ60598 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CttnQ60598 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CttnQ60598 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
CttnQ60598 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CttnQ60598 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
CttnQ60598 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CttnQ60598 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CttnQ60598 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CttnQ60598 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CttnQ60598 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CttnQ60598 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CttnQ60598 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CttnQ60598 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CttnQ60598 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CttnQ60598 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CttnQ60598 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CttnQ60598 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CttnQ60598 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CttnQ60598 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CttnQ60598 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CttnQ60598 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CttnQ60598 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CttnQ60598 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CttnQ60598 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CttnQ60598 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CttnQ60598 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CttnQ60598 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CttnQ60598 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CttnQ60598 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CttnQ60598 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CttnQ60598 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CttnQ60598 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CttnQ60598 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CttnQ60598 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CttnQ60598 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CttnQ60598 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CttnQ60598 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CttnQ60598 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CttnQ60598 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CttnQ60598 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CttnQ60598 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CttnQ60598 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CttnQ60598 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CttnQ60598 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CttnQ60598 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
CttnQ60598 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CttnQ60598 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
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CttnQ60598 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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CttnQ60598 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
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CttnQ60598 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CttnQ60598 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CttnQ60598 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CttnQ60598 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CttnQ60598 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CttnQ60598 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CttnQ60598 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
CttnQ60598 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CttnQ60598 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
CttnQ60598 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CttnQ60598 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CttnQ60598 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CttnQ60598 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CttnQ60598 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CttnQ60598 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CttnQ60598 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
CttnQ60598 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CttnQ60598 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CttnQ60598 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CttnQ60598 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CttnQ60598 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CttnQ60598 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CttnQ60598 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CttnQ60598 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CttnQ60598 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CttnQ60598 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CttnQ60598 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CttnQ60598 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms