Protein–RNA interactions for Protein: Q5SZ99

Trim38, Tripartite motif-containing 38, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Trim38Q5SZ99 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim38Q5SZ99 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Trim38Q5SZ99 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim38Q5SZ99 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim38Q5SZ99 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim38Q5SZ99 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim38Q5SZ99 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim38Q5SZ99 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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