Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSK3

Tefm, Transcription elongation factor, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TefmQ5SSK3 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TefmQ5SSK3 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TefmQ5SSK3 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
TefmQ5SSK3 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TefmQ5SSK3 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
TefmQ5SSK3 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
TefmQ5SSK3 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TefmQ5SSK3 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TefmQ5SSK3 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
TefmQ5SSK3 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TefmQ5SSK3 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TefmQ5SSK3 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TefmQ5SSK3 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TefmQ5SSK3 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TefmQ5SSK3 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TefmQ5SSK3 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TefmQ5SSK3 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
TefmQ5SSK3 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TefmQ5SSK3 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
TefmQ5SSK3 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
TefmQ5SSK3 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
TefmQ5SSK3 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
TefmQ5SSK3 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
TefmQ5SSK3 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
TefmQ5SSK3 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
TefmQ5SSK3 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
TefmQ5SSK3 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
TefmQ5SSK3 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
TefmQ5SSK3 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
TefmQ5SSK3 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
TefmQ5SSK3 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
TefmQ5SSK3 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
TefmQ5SSK3 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
TefmQ5SSK3 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
TefmQ5SSK3 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
TefmQ5SSK3 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
TefmQ5SSK3 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
TefmQ5SSK3 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
TefmQ5SSK3 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
TefmQ5SSK3 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
TefmQ5SSK3 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
TefmQ5SSK3 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
TefmQ5SSK3 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
TefmQ5SSK3 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
TefmQ5SSK3 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
TefmQ5SSK3 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
TefmQ5SSK3 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
TefmQ5SSK3 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
TefmQ5SSK3 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
TefmQ5SSK3 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
TefmQ5SSK3 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
TefmQ5SSK3 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
TefmQ5SSK3 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TefmQ5SSK3 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TefmQ5SSK3 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TefmQ5SSK3 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TefmQ5SSK3 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TefmQ5SSK3 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TefmQ5SSK3 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TefmQ5SSK3 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TefmQ5SSK3 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
TefmQ5SSK3 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
TefmQ5SSK3 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TefmQ5SSK3 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
TefmQ5SSK3 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TefmQ5SSK3 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TefmQ5SSK3 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TefmQ5SSK3 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TefmQ5SSK3 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TefmQ5SSK3 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TefmQ5SSK3 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TefmQ5SSK3 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TefmQ5SSK3 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TefmQ5SSK3 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
TefmQ5SSK3 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TefmQ5SSK3 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
TefmQ5SSK3 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TefmQ5SSK3 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
TefmQ5SSK3 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
TefmQ5SSK3 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TefmQ5SSK3 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
TefmQ5SSK3 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
TefmQ5SSK3 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TefmQ5SSK3 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
TefmQ5SSK3 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TefmQ5SSK3 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TefmQ5SSK3 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TefmQ5SSK3 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TefmQ5SSK3 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
TefmQ5SSK3 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TefmQ5SSK3 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TefmQ5SSK3 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TefmQ5SSK3 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TefmQ5SSK3 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TefmQ5SSK3 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TefmQ5SSK3 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
TefmQ5SSK3 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TefmQ5SSK3 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TefmQ5SSK3 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TefmQ5SSK3 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.7 ms