Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2

Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

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Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1Q5NCF2 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Lima1-201ENSMUST00000073691 4215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Brd1-202ENSMUST00000109380 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Corin-207ENSMUST00000177290 2943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 AI854703-201ENSMUST00000095938 3517 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Smad9-201ENSMUST00000029371 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Gm21103-202ENSMUST00000170923 1761 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Samd4-206ENSMUST00000137543 6874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Mthfsd-201ENSMUST00000047282 8312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Gm37613-201ENSMUST00000195677 3580 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Trmt12-201ENSMUST00000036937 4454 ntAPPRIS P1 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Gm10829-201ENSMUST00000202084 2988 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Erbb3-201ENSMUST00000082059 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Mapkbp1-201ENSMUST00000066058 6942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Mrrf-201ENSMUST00000028250 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Scyl2-204ENSMUST00000174252 4817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Thsd4-201ENSMUST00000034829 4816 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Gm17029-203ENSMUST00000153443 2758 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Trak2-201ENSMUST00000027186 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 Kcnh3-201ENSMUST00000041415 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
Trappc1Q5NCF2 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 Stard4-201ENSMUST00000025236 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 AC154314.2-201ENSMUST00000223677 3502 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 Sp6-201ENSMUST00000047997 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 Tie1-203ENSMUST00000184261 4234 ntTSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 Cacna1c-224ENSMUST00000219018 7516 ntTSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 Ptbp1-202ENSMUST00000095457 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 Ppp6r3-201ENSMUST00000025846 4841 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 Pde5a-201ENSMUST00000066728 6939 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 Ncapd3-205ENSMUST00000216677 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 Rasgrp4-210ENSMUST00000203070 3008 ntTSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 Rpap1-201ENSMUST00000048493 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 Tmem184a-202ENSMUST00000110832 4326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 Chd7-206ENSMUST00000170391 3462 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 Atp1a3-205ENSMUST00000196684 3642 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 Mtmr11-201ENSMUST00000054356 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 Myo5a-206ENSMUST00000136731 6480 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 Ugt1a10-201ENSMUST00000113142 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 Cd300lg-201ENSMUST00000017453 2353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
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