Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC9

Trim58, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM58, mousemouse

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Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim58Q5NCC9 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim58Q5NCC9 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim58Q5NCC9 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim58Q5NCC9 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim58Q5NCC9 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim58Q5NCC9 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim58Q5NCC9 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim58Q5NCC9 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim58Q5NCC9 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim58Q5NCC9 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim58Q5NCC9 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
Trim58Q5NCC9 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim58Q5NCC9 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim58Q5NCC9 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim58Q5NCC9 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim58Q5NCC9 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim58Q5NCC9 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim58Q5NCC9 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim58Q5NCC9 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim58Q5NCC9 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim58Q5NCC9 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim58Q5NCC9 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim58Q5NCC9 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
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Trim58Q5NCC9 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim58Q5NCC9 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim58Q5NCC9 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Trim58Q5NCC9 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim58Q5NCC9 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim58Q5NCC9 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim58Q5NCC9 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim58Q5NCC9 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Trim58Q5NCC9 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim58Q5NCC9 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim58Q5NCC9 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim58Q5NCC9 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim58Q5NCC9 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Trim58Q5NCC9 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim58Q5NCC9 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
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Trim58Q5NCC9 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Trim58Q5NCC9 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim58Q5NCC9 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim58Q5NCC9 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Trim58Q5NCC9 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Trim58Q5NCC9 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Trim58Q5NCC9 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim58Q5NCC9 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim58Q5NCC9 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim58Q5NCC9 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim58Q5NCC9 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim58Q5NCC9 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim58Q5NCC9 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim58Q5NCC9 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim58Q5NCC9 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim58Q5NCC9 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim58Q5NCC9 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim58Q5NCC9 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim58Q5NCC9 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim58Q5NCC9 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim58Q5NCC9 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim58Q5NCC9 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim58Q5NCC9 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim58Q5NCC9 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim58Q5NCC9 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim58Q5NCC9 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim58Q5NCC9 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim58Q5NCC9 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim58Q5NCC9 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim58Q5NCC9 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim58Q5NCC9 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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