Protein–RNA interactions for Protein: Q505F5

Lrrc47, Leucine-rich repeat-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 581 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc47Q505F5 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lrrc47Q505F5 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lrrc47Q505F5 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lrrc47Q505F5 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lrrc47Q505F5 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lrrc47Q505F5 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lrrc47Q505F5 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lrrc47Q505F5 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lrrc47Q505F5 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Lrrc47Q505F5 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Lrrc47Q505F5 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Lrrc47Q505F5 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Lrrc47Q505F5 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Lrrc47Q505F5 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Lrrc47Q505F5 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Lrrc47Q505F5 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Lrrc47Q505F5 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Lrrc47Q505F5 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Lrrc47Q505F5 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Lrrc47Q505F5 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Lrrc47Q505F5 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Lrrc47Q505F5 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Lrrc47Q505F5 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Lrrc47Q505F5 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Lrrc47Q505F5 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Lrrc47Q505F5 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Lrrc47Q505F5 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Lrrc47Q505F5 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Lrrc47Q505F5 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Lrrc47Q505F5 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Lrrc47Q505F5 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Lrrc47Q505F5 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Lrrc47Q505F5 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Lrrc47Q505F5 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Lrrc47Q505F5 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Lrrc47Q505F5 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Lrrc47Q505F5 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Lrrc47Q505F5 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Lrrc47Q505F5 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Lrrc47Q505F5 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Lrrc47Q505F5 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Lrrc47Q505F5 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Lrrc47Q505F5 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Lrrc47Q505F5 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Lrrc47Q505F5 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Lrrc47Q505F5 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Lrrc47Q505F5 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Lrrc47Q505F5 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Lrrc47Q505F5 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Lrrc47Q505F5 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Lrrc47Q505F5 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Lrrc47Q505F5 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Lrrc47Q505F5 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Lrrc47Q505F5 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Lrrc47Q505F5 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Lrrc47Q505F5 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Lrrc47Q505F5 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Lrrc47Q505F5 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Lrrc47Q505F5 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Lrrc47Q505F5 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Lrrc47Q505F5 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Lrrc47Q505F5 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Lrrc47Q505F5 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Lrrc47Q505F5 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Lrrc47Q505F5 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Lrrc47Q505F5 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Lrrc47Q505F5 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Lrrc47Q505F5 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Lrrc47Q505F5 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Lrrc47Q505F5 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Lrrc47Q505F5 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Lrrc47Q505F5 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Lrrc47Q505F5 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Lrrc47Q505F5 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Lrrc47Q505F5 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Lrrc47Q505F5 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Lrrc47Q505F5 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Lrrc47Q505F5 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Lrrc47Q505F5 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Lrrc47Q505F5 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Lrrc47Q505F5 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Lrrc47Q505F5 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Lrrc47Q505F5 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Lrrc47Q505F5 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Lrrc47Q505F5 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Lrrc47Q505F5 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Lrrc47Q505F5 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Lrrc47Q505F5 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Lrrc47Q505F5 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Lrrc47Q505F5 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Lrrc47Q505F5 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Lrrc47Q505F5 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Lrrc47Q505F5 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Lrrc47Q505F5 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Lrrc47Q505F5 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Lrrc47Q505F5 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Lrrc47Q505F5 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Lrrc47Q505F5 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Lrrc47Q505F5 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Lrrc47Q505F5 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
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