Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW13

D130052B06Rik, RIKEN cDNA D130052B06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D130052B06RikQ3UW13 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC8.64□□□□□ -1.03
D130052B06RikQ3UW13 Gm5441-201ENSMUST00000186454 5181 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
D130052B06RikQ3UW13 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
D130052B06RikQ3UW13 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
D130052B06RikQ3UW13 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
D130052B06RikQ3UW13 Ncapd3-205ENSMUST00000216677 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
D130052B06RikQ3UW13 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
D130052B06RikQ3UW13 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
D130052B06RikQ3UW13 Cacna1c-222ENSMUST00000190285 6585 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
D130052B06RikQ3UW13 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
D130052B06RikQ3UW13 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
D130052B06RikQ3UW13 Asxl2-207ENSMUST00000153102 4462 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
D130052B06RikQ3UW13 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
D130052B06RikQ3UW13 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
D130052B06RikQ3UW13 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
D130052B06RikQ3UW13 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
D130052B06RikQ3UW13 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
D130052B06RikQ3UW13 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
D130052B06RikQ3UW13 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
D130052B06RikQ3UW13 Tfap2b-201ENSMUST00000027059 5863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
D130052B06RikQ3UW13 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
D130052B06RikQ3UW13 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.63□□□□□ -1.03
D130052B06RikQ3UW13 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
D130052B06RikQ3UW13 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
D130052B06RikQ3UW13 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
D130052B06RikQ3UW13 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC8.63□□□□□ -1.03
D130052B06RikQ3UW13 Slc9a8-201ENSMUST00000047815 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
D130052B06RikQ3UW13 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.63□□□□□ -1.03
D130052B06RikQ3UW13 Jade1-201ENSMUST00000026865 5481 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
D130052B06RikQ3UW13 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
D130052B06RikQ3UW13 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
D130052B06RikQ3UW13 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
D130052B06RikQ3UW13 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC8.63□□□□□ -1.03
D130052B06RikQ3UW13 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
D130052B06RikQ3UW13 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
D130052B06RikQ3UW13 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC8.63□□□□□ -1.03
D130052B06RikQ3UW13 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
D130052B06RikQ3UW13 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.63□□□□□ -1.03
D130052B06RikQ3UW13 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
D130052B06RikQ3UW13 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC8.63□□□□□ -1.03
D130052B06RikQ3UW13 Acot11-202ENSMUST00000102762 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
D130052B06RikQ3UW13 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
D130052B06RikQ3UW13 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
D130052B06RikQ3UW13 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
D130052B06RikQ3UW13 Tenm2-202ENSMUST00000102801 9908 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
D130052B06RikQ3UW13 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
D130052B06RikQ3UW13 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
D130052B06RikQ3UW13 Nckap5-208ENSMUST00000161954 7090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
D130052B06RikQ3UW13 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC8.63□□□□□ -1.03
D130052B06RikQ3UW13 Rbm27-201ENSMUST00000046972 6134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
D130052B06RikQ3UW13 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
D130052B06RikQ3UW13 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.63□□□□□ -1.03
D130052B06RikQ3UW13 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
D130052B06RikQ3UW13 Gpr149-201ENSMUST00000058535 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
D130052B06RikQ3UW13 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
D130052B06RikQ3UW13 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
D130052B06RikQ3UW13 Tgfbrap1-201ENSMUST00000095014 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
D130052B06RikQ3UW13 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
D130052B06RikQ3UW13 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
D130052B06RikQ3UW13 Fgf6-201ENSMUST00000000187 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
D130052B06RikQ3UW13 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
D130052B06RikQ3UW13 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
D130052B06RikQ3UW13 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
D130052B06RikQ3UW13 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
D130052B06RikQ3UW13 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC8.63□□□□□ -1.03
D130052B06RikQ3UW13 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC8.63□□□□□ -1.03
D130052B06RikQ3UW13 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
D130052B06RikQ3UW13 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
D130052B06RikQ3UW13 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
D130052B06RikQ3UW13 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
D130052B06RikQ3UW13 Adam22-202ENSMUST00000050166 8969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.62□□□□□ -1.03
D130052B06RikQ3UW13 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.62□□□□□ -1.03
D130052B06RikQ3UW13 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
D130052B06RikQ3UW13 Mecomos-201ENSMUST00000125611 5510 ntTSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
D130052B06RikQ3UW13 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
D130052B06RikQ3UW13 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
D130052B06RikQ3UW13 Nlgn3-201ENSMUST00000065858 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
D130052B06RikQ3UW13 Pcdh15-226ENSMUST00000151116 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.62□□□□□ -1.03
D130052B06RikQ3UW13 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC8.62□□□□□ -1.03
D130052B06RikQ3UW13 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
D130052B06RikQ3UW13 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
D130052B06RikQ3UW13 Clec14a-201ENSMUST00000062254 4571 ntAPPRIS P1 BASIC8.62□□□□□ -1.03
D130052B06RikQ3UW13 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
D130052B06RikQ3UW13 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
D130052B06RikQ3UW13 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
D130052B06RikQ3UW13 Tyw3-201ENSMUST00000052774 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
D130052B06RikQ3UW13 Kat6b-201ENSMUST00000069648 7649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.62□□□□□ -1.03
D130052B06RikQ3UW13 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
D130052B06RikQ3UW13 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
D130052B06RikQ3UW13 Mir124a-1hg-201ENSMUST00000180610 4103 ntTSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
D130052B06RikQ3UW13 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.62□□□□□ -1.03
D130052B06RikQ3UW13 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.62□□□□□ -1.03
D130052B06RikQ3UW13 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC8.62□□□□□ -1.03
D130052B06RikQ3UW13 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
D130052B06RikQ3UW13 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC8.62□□□□□ -1.03
D130052B06RikQ3UW13 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
D130052B06RikQ3UW13 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
D130052B06RikQ3UW13 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
D130052B06RikQ3UW13 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
D130052B06RikQ3UW13 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms