Protein–RNA interactions for Protein: Q3UU56

Gm29609, Predicted gene 29609, mousemouse

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Length 907 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm29609Q3UU56 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm29609Q3UU56 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm29609Q3UU56 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm29609Q3UU56 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm29609Q3UU56 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm29609Q3UU56 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm29609Q3UU56 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm29609Q3UU56 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm29609Q3UU56 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm29609Q3UU56 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm29609Q3UU56 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm29609Q3UU56 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm29609Q3UU56 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm29609Q3UU56 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm29609Q3UU56 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm29609Q3UU56 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm29609Q3UU56 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm29609Q3UU56 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm29609Q3UU56 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm29609Q3UU56 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm29609Q3UU56 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm29609Q3UU56 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm29609Q3UU56 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm29609Q3UU56 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm29609Q3UU56 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm29609Q3UU56 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm29609Q3UU56 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm29609Q3UU56 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm29609Q3UU56 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm29609Q3UU56 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm29609Q3UU56 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm29609Q3UU56 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm29609Q3UU56 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm29609Q3UU56 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm29609Q3UU56 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm29609Q3UU56 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm29609Q3UU56 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm29609Q3UU56 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm29609Q3UU56 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm29609Q3UU56 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm29609Q3UU56 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm29609Q3UU56 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm29609Q3UU56 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm29609Q3UU56 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm29609Q3UU56 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm29609Q3UU56 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm29609Q3UU56 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm29609Q3UU56 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm29609Q3UU56 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm29609Q3UU56 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm29609Q3UU56 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm29609Q3UU56 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm29609Q3UU56 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm29609Q3UU56 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm29609Q3UU56 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm29609Q3UU56 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm29609Q3UU56 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm29609Q3UU56 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm29609Q3UU56 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm29609Q3UU56 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm29609Q3UU56 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm29609Q3UU56 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm29609Q3UU56 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Gm29609Q3UU56 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm29609Q3UU56 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm29609Q3UU56 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm29609Q3UU56 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Gm29609Q3UU56 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm29609Q3UU56 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm29609Q3UU56 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm29609Q3UU56 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm29609Q3UU56 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm29609Q3UU56 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm29609Q3UU56 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm29609Q3UU56 Lce1e-201ENSMUST00000090867 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm29609Q3UU56 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm29609Q3UU56 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm29609Q3UU56 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm29609Q3UU56 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm29609Q3UU56 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm29609Q3UU56 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm29609Q3UU56 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm29609Q3UU56 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm29609Q3UU56 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm29609Q3UU56 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm29609Q3UU56 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm29609Q3UU56 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm29609Q3UU56 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm29609Q3UU56 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm29609Q3UU56 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm29609Q3UU56 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm29609Q3UU56 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm29609Q3UU56 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm29609Q3UU56 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm29609Q3UU56 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
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