Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGY8

Arfgef3, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 2,170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfgef3Q3UGY8 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Arfgef3Q3UGY8 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Arfgef3Q3UGY8 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Arfgef3Q3UGY8 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Arfgef3Q3UGY8 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Arfgef3Q3UGY8 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Arfgef3Q3UGY8 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Arfgef3Q3UGY8 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Arfgef3Q3UGY8 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
Arfgef3Q3UGY8 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
Arfgef3Q3UGY8 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Arfgef3Q3UGY8 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Arfgef3Q3UGY8 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
Arfgef3Q3UGY8 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
Arfgef3Q3UGY8 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
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Arfgef3Q3UGY8 1700012P22Rik-201ENSMUST00000030323 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
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Arfgef3Q3UGY8 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Arfgef3Q3UGY8 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Arfgef3Q3UGY8 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Arfgef3Q3UGY8 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Arfgef3Q3UGY8 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Arfgef3Q3UGY8 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Arfgef3Q3UGY8 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Arfgef3Q3UGY8 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Arfgef3Q3UGY8 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Arfgef3Q3UGY8 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Arfgef3Q3UGY8 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Arfgef3Q3UGY8 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Arfgef3Q3UGY8 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
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Arfgef3Q3UGY8 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Arfgef3Q3UGY8 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Arfgef3Q3UGY8 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
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Arfgef3Q3UGY8 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Arfgef3Q3UGY8 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Arfgef3Q3UGY8 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Arfgef3Q3UGY8 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
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Arfgef3Q3UGY8 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Arfgef3Q3UGY8 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Arfgef3Q3UGY8 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Arfgef3Q3UGY8 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Arfgef3Q3UGY8 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Arfgef3Q3UGY8 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Arfgef3Q3UGY8 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Arfgef3Q3UGY8 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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Arfgef3Q3UGY8 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Arfgef3Q3UGY8 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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Arfgef3Q3UGY8 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Arfgef3Q3UGY8 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Arfgef3Q3UGY8 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Arfgef3Q3UGY8 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Arfgef3Q3UGY8 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Arfgef3Q3UGY8 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Arfgef3Q3UGY8 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Arfgef3Q3UGY8 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Arfgef3Q3UGY8 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Arfgef3Q3UGY8 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
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Arfgef3Q3UGY8 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Arfgef3Q3UGY8 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Arfgef3Q3UGY8 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Arfgef3Q3UGY8 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Arfgef3Q3UGY8 Ywhaq-ps2-201ENSMUST00000117738 643 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Arfgef3Q3UGY8 Gm13937-201ENSMUST00000121000 988 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Arfgef3Q3UGY8 Crhr2-204ENSMUST00000164012 1263 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Arfgef3Q3UGY8 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Arfgef3Q3UGY8 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Arfgef3Q3UGY8 Gm37028-201ENSMUST00000194276 107 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Arfgef3Q3UGY8 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Arfgef3Q3UGY8 Gm45285-201ENSMUST00000210418 749 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Arfgef3Q3UGY8 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms