Protein–RNA interactions for Protein: Q3U827

Rnf180, E3 ubiquitin-protein ligase RNF180, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf180Q3U827 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf180Q3U827 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf180Q3U827 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf180Q3U827 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf180Q3U827 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf180Q3U827 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf180Q3U827 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf180Q3U827 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf180Q3U827 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rnf180Q3U827 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rnf180Q3U827 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rnf180Q3U827 Cfap61-201ENSMUST00000116398 1561 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rnf180Q3U827 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rnf180Q3U827 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rnf180Q3U827 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rnf180Q3U827 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rnf180Q3U827 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rnf180Q3U827 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rnf180Q3U827 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rnf180Q3U827 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rnf180Q3U827 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rnf180Q3U827 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rnf180Q3U827 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Rnf180Q3U827 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Rnf180Q3U827 Gm12666-201ENSMUST00000123179 764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Rnf180Q3U827 Dydc1-202ENSMUST00000161837 829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rnf180Q3U827 Pfdn5-203ENSMUST00000165671 830 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rnf180Q3U827 Tmem242-202ENSMUST00000185896 780 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rnf180Q3U827 Gm18776-201ENSMUST00000188833 654 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Rnf180Q3U827 Marc1-203ENSMUST00000189492 1239 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rnf180Q3U827 Gm37638-201ENSMUST00000194337 1123 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Rnf180Q3U827 4930573C15Rik-201ENSMUST00000197707 777 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rnf180Q3U827 Apoa5-205ENSMUST00000215187 495 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Rnf180Q3U827 P2rx7-202ENSMUST00000086247 712 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rnf180Q3U827 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rnf180Q3U827 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rnf180Q3U827 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rnf180Q3U827 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rnf180Q3U827 Gm6641-201ENSMUST00000196100 1315 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Rnf180Q3U827 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rnf180Q3U827 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rnf180Q3U827 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rnf180Q3U827 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rnf180Q3U827 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rnf180Q3U827 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rnf180Q3U827 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rnf180Q3U827 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rnf180Q3U827 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rnf180Q3U827 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rnf180Q3U827 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Rnf180Q3U827 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rnf180Q3U827 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rnf180Q3U827 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rnf180Q3U827 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rnf180Q3U827 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Rnf180Q3U827 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rnf180Q3U827 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Rnf180Q3U827 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Rnf180Q3U827 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rnf180Q3U827 Pigx-212ENSMUST00000215073 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Rnf180Q3U827 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rnf180Q3U827 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rnf180Q3U827 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rnf180Q3U827 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rnf180Q3U827 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rnf180Q3U827 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rnf180Q3U827 Kyat1-202ENSMUST00000113659 1367 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rnf180Q3U827 AC159810.1-201ENSMUST00000214838 1480 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Rnf180Q3U827 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rnf180Q3U827 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rnf180Q3U827 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rnf180Q3U827 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Rnf180Q3U827 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rnf180Q3U827 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Rnf180Q3U827 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rnf180Q3U827 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rnf180Q3U827 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rnf180Q3U827 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rnf180Q3U827 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rnf180Q3U827 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rnf180Q3U827 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rnf180Q3U827 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rnf180Q3U827 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rnf180Q3U827 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rnf180Q3U827 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rnf180Q3U827 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rnf180Q3U827 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
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