Protein–RNA interactions for Protein: Q3U319

Rnf40, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1B, mousemouse

Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf40Q3U319 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf40Q3U319 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf40Q3U319 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf40Q3U319 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf40Q3U319 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf40Q3U319 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf40Q3U319 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf40Q3U319 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf40Q3U319 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf40Q3U319 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf40Q3U319 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf40Q3U319 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf40Q3U319 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf40Q3U319 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf40Q3U319 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf40Q3U319 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf40Q3U319 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf40Q3U319 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rnf40Q3U319 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rnf40Q3U319 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rnf40Q3U319 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rnf40Q3U319 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rnf40Q3U319 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rnf40Q3U319 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rnf40Q3U319 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rnf40Q3U319 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rnf40Q3U319 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rnf40Q3U319 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rnf40Q3U319 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rnf40Q3U319 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rnf40Q3U319 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Rnf40Q3U319 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rnf40Q3U319 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rnf40Q3U319 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Rnf40Q3U319 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rnf40Q3U319 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rnf40Q3U319 Mir669o-201ENSMUST00000103898 96 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Rnf40Q3U319 Gm1866-201ENSMUST00000120701 477 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
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Rnf40Q3U319 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rnf40Q3U319 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rnf40Q3U319 Gm4791-201ENSMUST00000178065 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rnf40Q3U319 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rnf40Q3U319 Gm35216-201ENSMUST00000203777 433 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rnf40Q3U319 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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Rnf40Q3U319 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Rnf40Q3U319 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rnf40Q3U319 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rnf40Q3U319 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rnf40Q3U319 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rnf40Q3U319 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rnf40Q3U319 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rnf40Q3U319 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rnf40Q3U319 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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Rnf40Q3U319 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rnf40Q3U319 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rnf40Q3U319 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rnf40Q3U319 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rnf40Q3U319 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rnf40Q3U319 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rnf40Q3U319 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rnf40Q3U319 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rnf40Q3U319 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
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Rnf40Q3U319 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rnf40Q3U319 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rnf40Q3U319 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rnf40Q3U319 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rnf40Q3U319 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rnf40Q3U319 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rnf40Q3U319 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rnf40Q3U319 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rnf40Q3U319 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rnf40Q3U319 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rnf40Q3U319 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rnf40Q3U319 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rnf40Q3U319 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rnf40Q3U319 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Rnf40Q3U319 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Rnf40Q3U319 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Rnf40Q3U319 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rnf40Q3U319 Gm45276-201ENSMUST00000209549 1086 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Rnf40Q3U319 AC153932.1-201ENSMUST00000218558 787 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Rnf40Q3U319 Msmb-201ENSMUST00000022464 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rnf40Q3U319 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Rnf40Q3U319 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rnf40Q3U319 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rnf40Q3U319 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rnf40Q3U319 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rnf40Q3U319 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rnf40Q3U319 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rnf40Q3U319 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rnf40Q3U319 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rnf40Q3U319 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rnf40Q3U319 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rnf40Q3U319 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rnf40Q3U319 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rnf40Q3U319 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
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