Protein–RNA interactions for Protein: Q3TR08

Fndc4, Fibronectin type III domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 231 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc4Q3TR08 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
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