Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXD3

Hddc2, HD domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc2Q3SXD3 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 C2cd5-213ENSMUST00000204655 3526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Lamb1-205ENSMUST00000169088 5557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Cep250-202ENSMUST00000094421 7919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Alox12-201ENSMUST00000000329 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Raph1-204ENSMUST00000140485 10024 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Ror2-202ENSMUST00000130235 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Ccdc57-201ENSMUST00000056781 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Rxra-206ENSMUST00000166775 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Med13l-201ENSMUST00000100816 9296 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hddc2Q3SXD3 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms