Protein–RNA interactions for Protein: Q3MI99

Ccbe1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 408 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccbe1Q3MI99 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccbe1Q3MI99 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccbe1Q3MI99 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccbe1Q3MI99 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccbe1Q3MI99 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccbe1Q3MI99 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccbe1Q3MI99 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccbe1Q3MI99 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccbe1Q3MI99 Mum1l1-204ENSMUST00000113045 4523 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccbe1Q3MI99 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccbe1Q3MI99 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccbe1Q3MI99 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccbe1Q3MI99 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccbe1Q3MI99 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccbe1Q3MI99 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccbe1Q3MI99 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccbe1Q3MI99 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccbe1Q3MI99 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccbe1Q3MI99 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccbe1Q3MI99 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccbe1Q3MI99 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccbe1Q3MI99 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccbe1Q3MI99 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccbe1Q3MI99 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccbe1Q3MI99 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccbe1Q3MI99 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccbe1Q3MI99 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccbe1Q3MI99 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccbe1Q3MI99 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccbe1Q3MI99 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccbe1Q3MI99 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccbe1Q3MI99 Nckap5-212ENSMUST00000162877 2630 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccbe1Q3MI99 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccbe1Q3MI99 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccbe1Q3MI99 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccbe1Q3MI99 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccbe1Q3MI99 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccbe1Q3MI99 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccbe1Q3MI99 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccbe1Q3MI99 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccbe1Q3MI99 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccbe1Q3MI99 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccbe1Q3MI99 Cfap61-202ENSMUST00000118002 3230 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccbe1Q3MI99 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccbe1Q3MI99 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccbe1Q3MI99 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccbe1Q3MI99 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccbe1Q3MI99 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccbe1Q3MI99 Riok3-201ENSMUST00000025270 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccbe1Q3MI99 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Ccbe1Q3MI99 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Ccbe1Q3MI99 Gm37580-201ENSMUST00000192408 2800 ntBASIC11.4□□□□□ -0.59
Ccbe1Q3MI99 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Ccbe1Q3MI99 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Ccbe1Q3MI99 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccbe1Q3MI99 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccbe1Q3MI99 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccbe1Q3MI99 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccbe1Q3MI99 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccbe1Q3MI99 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccbe1Q3MI99 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccbe1Q3MI99 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccbe1Q3MI99 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccbe1Q3MI99 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccbe1Q3MI99 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccbe1Q3MI99 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccbe1Q3MI99 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccbe1Q3MI99 Cir1-201ENSMUST00000058615 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccbe1Q3MI99 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccbe1Q3MI99 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccbe1Q3MI99 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccbe1Q3MI99 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccbe1Q3MI99 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccbe1Q3MI99 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccbe1Q3MI99 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccbe1Q3MI99 Gm42669-202ENSMUST00000160160 3080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccbe1Q3MI99 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccbe1Q3MI99 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccbe1Q3MI99 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccbe1Q3MI99 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccbe1Q3MI99 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccbe1Q3MI99 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccbe1Q3MI99 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccbe1Q3MI99 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccbe1Q3MI99 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccbe1Q3MI99 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccbe1Q3MI99 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccbe1Q3MI99 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccbe1Q3MI99 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccbe1Q3MI99 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccbe1Q3MI99 Cyp2s1-202ENSMUST00000108395 3161 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccbe1Q3MI99 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccbe1Q3MI99 4931406C07Rik-201ENSMUST00000034414 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccbe1Q3MI99 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccbe1Q3MI99 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccbe1Q3MI99 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccbe1Q3MI99 Gm26865-201ENSMUST00000180970 3284 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccbe1Q3MI99 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccbe1Q3MI99 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccbe1Q3MI99 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
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