Protein–RNA interactions for Protein: Q2QI47

Ush2A, Usherin, mousemouse

Predictions only

Length 5,193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ush2AQ2QI47 Krtap4-1-201ENSMUST00000081007 1015 ntAPPRIS P1 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Ush2AQ2QI47 Gm38348-201ENSMUST00000191718 2273 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Ush2AQ2QI47 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Ush2AQ2QI47 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Ush2AQ2QI47 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Ush2AQ2QI47 Rad18-204ENSMUST00000113182 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Ush2AQ2QI47 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Ush2AQ2QI47 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Ush2AQ2QI47 Tstd1-201ENSMUST00000171362 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Ush2AQ2QI47 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Ush2AQ2QI47 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Ush2AQ2QI47 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Ush2AQ2QI47 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Ush2AQ2QI47 Gm37582-201ENSMUST00000192953 1409 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Ush2AQ2QI47 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Ush2AQ2QI47 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Ush2AQ2QI47 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Ush2AQ2QI47 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Ush2AQ2QI47 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Ush2AQ2QI47 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Ush2AQ2QI47 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Ush2AQ2QI47 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Ush2AQ2QI47 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Ush2AQ2QI47 Dnmt3l-ps1-201ENSMUST00000118734 1253 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Ush2AQ2QI47 Elobl-203ENSMUST00000121228 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Ush2AQ2QI47 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Ush2AQ2QI47 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Ush2AQ2QI47 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Ush2AQ2QI47 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Ush2AQ2QI47 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Ush2AQ2QI47 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Ush2AQ2QI47 Klf3-202ENSMUST00000166409 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Ush2AQ2QI47 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Ush2AQ2QI47 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Ush2AQ2QI47 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Ush2AQ2QI47 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Ush2AQ2QI47 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Ush2AQ2QI47 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Ush2AQ2QI47 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Ush2AQ2QI47 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Ush2AQ2QI47 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Ush2AQ2QI47 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Ush2AQ2QI47 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Ush2AQ2QI47 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Ush2AQ2QI47 Cd300ld5-201ENSMUST00000100239 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Ush2AQ2QI47 Cd300ld4-201ENSMUST00000100240 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Ush2AQ2QI47 Fhl3-202ENSMUST00000106199 1139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Ush2AQ2QI47 Nutf2-202ENSMUST00000212042 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Ush2AQ2QI47 Cd300ld3-201ENSMUST00000092459 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Ush2AQ2QI47 Ctxn2-201ENSMUST00000099452 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Ush2AQ2QI47 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Ush2AQ2QI47 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Ush2AQ2QI47 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Ush2AQ2QI47 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Ush2AQ2QI47 Olfr582-203ENSMUST00000211036 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Ush2AQ2QI47 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Ush2AQ2QI47 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Ush2AQ2QI47 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Ush2AQ2QI47 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Ush2AQ2QI47 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Ush2AQ2QI47 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Ush2AQ2QI47 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Ush2AQ2QI47 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Ush2AQ2QI47 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Ush2AQ2QI47 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Ush2AQ2QI47 Gm7781-201ENSMUST00000117258 788 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Ush2AQ2QI47 Gm11475-201ENSMUST00000118482 476 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Ush2AQ2QI47 Gm6881-201ENSMUST00000121811 833 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Ush2AQ2QI47 Gm42687-201ENSMUST00000199075 164 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Ush2AQ2QI47 AC134607.1-201ENSMUST00000214707 485 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Ush2AQ2QI47 Gm7525-201ENSMUST00000219425 454 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Ush2AQ2QI47 AC154305.2-201ENSMUST00000225813 901 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Ush2AQ2QI47 AC101205.2-201ENSMUST00000226206 715 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Ush2AQ2QI47 4933407L21Rik-201ENSMUST00000027426 1146 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Ush2AQ2QI47 Ttc24-202ENSMUST00000064550 671 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Ush2AQ2QI47 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Ush2AQ2QI47 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Ush2AQ2QI47 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Ush2AQ2QI47 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Ush2AQ2QI47 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Ush2AQ2QI47 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Ush2AQ2QI47 Trmt10b-202ENSMUST00000107800 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Ush2AQ2QI47 Rgs8-205ENSMUST00000111815 765 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Ush2AQ2QI47 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Ush2AQ2QI47 Cldnd2-202ENSMUST00000206839 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Ush2AQ2QI47 Gm39147-202ENSMUST00000211730 882 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Ush2AQ2QI47 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Ush2AQ2QI47 Eef1akmt1-201ENSMUST00000022518 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Ush2AQ2QI47 Ifnl3-201ENSMUST00000078364 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Ush2AQ2QI47 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Ush2AQ2QI47 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Ush2AQ2QI47 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Ush2AQ2QI47 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Ush2AQ2QI47 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Ush2AQ2QI47 Trav13-2-201ENSMUST00000103658 390 ntAPPRIS P1 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Ush2AQ2QI47 Gm18001-201ENSMUST00000212023 688 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Ush2AQ2QI47 Ly86-201ENSMUST00000021860 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Ush2AQ2QI47 AC163646.3-201ENSMUST00000228879 772 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Ush2AQ2QI47 Adig-201ENSMUST00000059889 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Ush2AQ2QI47 Cks2-201ENSMUST00000075853 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.9 ms