Protein–RNA interactions for Protein: Q24JP3

Fam178b, Protein FAM178B, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam178bQ24JP3 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fam178bQ24JP3 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fam178bQ24JP3 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fam178bQ24JP3 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fam178bQ24JP3 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Fam178bQ24JP3 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fam178bQ24JP3 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fam178bQ24JP3 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fam178bQ24JP3 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fam178bQ24JP3 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fam178bQ24JP3 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fam178bQ24JP3 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fam178bQ24JP3 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fam178bQ24JP3 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fam178bQ24JP3 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fam178bQ24JP3 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fam178bQ24JP3 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fam178bQ24JP3 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fam178bQ24JP3 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Fam178bQ24JP3 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fam178bQ24JP3 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fam178bQ24JP3 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fam178bQ24JP3 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Fam178bQ24JP3 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fam178bQ24JP3 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fam178bQ24JP3 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fam178bQ24JP3 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fam178bQ24JP3 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fam178bQ24JP3 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fam178bQ24JP3 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fam178bQ24JP3 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fam178bQ24JP3 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fam178bQ24JP3 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fam178bQ24JP3 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fam178bQ24JP3 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fam178bQ24JP3 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fam178bQ24JP3 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Fam178bQ24JP3 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Fam178bQ24JP3 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Fam178bQ24JP3 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Fam178bQ24JP3 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Fam178bQ24JP3 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Fam178bQ24JP3 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Fam178bQ24JP3 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Fam178bQ24JP3 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Fam178bQ24JP3 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Fam178bQ24JP3 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Fam178bQ24JP3 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Fam178bQ24JP3 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Fam178bQ24JP3 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Fam178bQ24JP3 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Fam178bQ24JP3 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Fam178bQ24JP3 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Fam178bQ24JP3 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Fam178bQ24JP3 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Fam178bQ24JP3 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Fam178bQ24JP3 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Fam178bQ24JP3 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Fam178bQ24JP3 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Fam178bQ24JP3 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Fam178bQ24JP3 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Fam178bQ24JP3 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Fam178bQ24JP3 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Fam178bQ24JP3 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Fam178bQ24JP3 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Fam178bQ24JP3 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Fam178bQ24JP3 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Fam178bQ24JP3 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Fam178bQ24JP3 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Fam178bQ24JP3 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Fam178bQ24JP3 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Fam178bQ24JP3 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Fam178bQ24JP3 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Fam178bQ24JP3 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Fam178bQ24JP3 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Fam178bQ24JP3 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Fam178bQ24JP3 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Fam178bQ24JP3 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Fam178bQ24JP3 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Fam178bQ24JP3 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Fam178bQ24JP3 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Fam178bQ24JP3 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Fam178bQ24JP3 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Fam178bQ24JP3 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Fam178bQ24JP3 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Fam178bQ24JP3 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Fam178bQ24JP3 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Fam178bQ24JP3 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Fam178bQ24JP3 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Fam178bQ24JP3 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Fam178bQ24JP3 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Fam178bQ24JP3 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Fam178bQ24JP3 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Fam178bQ24JP3 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Fam178bQ24JP3 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Fam178bQ24JP3 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Fam178bQ24JP3 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Fam178bQ24JP3 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Fam178bQ24JP3 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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