Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

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Length 625 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Traf3ip1Q149C2 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Traf3ip1Q149C2 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Traf3ip1Q149C2 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Traf3ip1Q149C2 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Traf3ip1Q149C2 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Traf3ip1Q149C2 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Traf3ip1Q149C2 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Traf3ip1Q149C2 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Traf3ip1Q149C2 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Traf3ip1Q149C2 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Traf3ip1Q149C2 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Traf3ip1Q149C2 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Traf3ip1Q149C2 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Traf3ip1Q149C2 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Traf3ip1Q149C2 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Traf3ip1Q149C2 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Traf3ip1Q149C2 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Traf3ip1Q149C2 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Traf3ip1Q149C2 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Traf3ip1Q149C2 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Traf3ip1Q149C2 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Traf3ip1Q149C2 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Traf3ip1Q149C2 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Traf3ip1Q149C2 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Traf3ip1Q149C2 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Traf3ip1Q149C2 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Traf3ip1Q149C2 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Traf3ip1Q149C2 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Traf3ip1Q149C2 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Traf3ip1Q149C2 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Traf3ip1Q149C2 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Traf3ip1Q149C2 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Traf3ip1Q149C2 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Traf3ip1Q149C2 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Traf3ip1Q149C2 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Traf3ip1Q149C2 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Traf3ip1Q149C2 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Traf3ip1Q149C2 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Traf3ip1Q149C2 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Traf3ip1Q149C2 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Traf3ip1Q149C2 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Traf3ip1Q149C2 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Traf3ip1Q149C2 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Traf3ip1Q149C2 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Traf3ip1Q149C2 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Traf3ip1Q149C2 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Traf3ip1Q149C2 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Traf3ip1Q149C2 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Traf3ip1Q149C2 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Traf3ip1Q149C2 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Traf3ip1Q149C2 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Traf3ip1Q149C2 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Traf3ip1Q149C2 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Traf3ip1Q149C2 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Traf3ip1Q149C2 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Traf3ip1Q149C2 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Traf3ip1Q149C2 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Traf3ip1Q149C2 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Traf3ip1Q149C2 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Traf3ip1Q149C2 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Traf3ip1Q149C2 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Traf3ip1Q149C2 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Traf3ip1Q149C2 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Traf3ip1Q149C2 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Traf3ip1Q149C2 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Traf3ip1Q149C2 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Traf3ip1Q149C2 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Traf3ip1Q149C2 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Traf3ip1Q149C2 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Traf3ip1Q149C2 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Traf3ip1Q149C2 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Traf3ip1Q149C2 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Traf3ip1Q149C2 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Traf3ip1Q149C2 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Traf3ip1Q149C2 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Traf3ip1Q149C2 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Traf3ip1Q149C2 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Traf3ip1Q149C2 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Traf3ip1Q149C2 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Traf3ip1Q149C2 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Traf3ip1Q149C2 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Traf3ip1Q149C2 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Traf3ip1Q149C2 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Traf3ip1Q149C2 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Traf3ip1Q149C2 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Traf3ip1Q149C2 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Traf3ip1Q149C2 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Traf3ip1Q149C2 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Traf3ip1Q149C2 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Traf3ip1Q149C2 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Traf3ip1Q149C2 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Traf3ip1Q149C2 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Traf3ip1Q149C2 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Traf3ip1Q149C2 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Traf3ip1Q149C2 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Traf3ip1Q149C2 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Traf3ip1Q149C2 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Traf3ip1Q149C2 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Traf3ip1Q149C2 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms