Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

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Length 604 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Ttc39dQ0VF76 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ttc39dQ0VF76 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ttc39dQ0VF76 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Ttc39dQ0VF76 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Ttc39dQ0VF76 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Ttc39dQ0VF76 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ttc39dQ0VF76 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ttc39dQ0VF76 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ttc39dQ0VF76 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ttc39dQ0VF76 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ttc39dQ0VF76 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ttc39dQ0VF76 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ttc39dQ0VF76 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ttc39dQ0VF76 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ttc39dQ0VF76 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ttc39dQ0VF76 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ttc39dQ0VF76 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ttc39dQ0VF76 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Ttc39dQ0VF76 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ttc39dQ0VF76 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Ttc39dQ0VF76 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ttc39dQ0VF76 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ttc39dQ0VF76 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ttc39dQ0VF76 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ttc39dQ0VF76 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ttc39dQ0VF76 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ttc39dQ0VF76 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ttc39dQ0VF76 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ttc39dQ0VF76 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Ttc39dQ0VF76 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ttc39dQ0VF76 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ttc39dQ0VF76 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ttc39dQ0VF76 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ttc39dQ0VF76 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ttc39dQ0VF76 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Ttc39dQ0VF76 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Ttc39dQ0VF76 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Ttc39dQ0VF76 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Ttc39dQ0VF76 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ttc39dQ0VF76 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Ttc39dQ0VF76 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ttc39dQ0VF76 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ttc39dQ0VF76 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Ttc39dQ0VF76 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Ttc39dQ0VF76 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Ttc39dQ0VF76 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
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Ttc39dQ0VF76 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ttc39dQ0VF76 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ttc39dQ0VF76 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ttc39dQ0VF76 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ttc39dQ0VF76 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ttc39dQ0VF76 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ttc39dQ0VF76 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ttc39dQ0VF76 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ttc39dQ0VF76 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ttc39dQ0VF76 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Ttc39dQ0VF76 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ttc39dQ0VF76 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
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Ttc39dQ0VF76 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ttc39dQ0VF76 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
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Ttc39dQ0VF76 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Ttc39dQ0VF76 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ttc39dQ0VF76 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ttc39dQ0VF76 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ttc39dQ0VF76 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Ttc39dQ0VF76 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Ttc39dQ0VF76 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
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Ttc39dQ0VF76 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Ttc39dQ0VF76 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Ttc39dQ0VF76 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ttc39dQ0VF76 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ttc39dQ0VF76 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ttc39dQ0VF76 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Ttc39dQ0VF76 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ttc39dQ0VF76 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ttc39dQ0VF76 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ttc39dQ0VF76 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ttc39dQ0VF76 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ttc39dQ0VF76 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Ttc39dQ0VF76 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ttc39dQ0VF76 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ttc39dQ0VF76 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ttc39dQ0VF76 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
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