Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5X1

Lrriq1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 1,673 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrriq1Q0P5X1 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lrriq1Q0P5X1 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lrriq1Q0P5X1 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lrriq1Q0P5X1 Gm11554-201ENSMUST00000105056 890 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lrriq1Q0P5X1 Defa-ps17-201ENSMUST00000121849 171 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Lrriq1Q0P5X1 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lrriq1Q0P5X1 Gm4895-201ENSMUST00000181646 1137 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Lrriq1Q0P5X1 Gm43506-201ENSMUST00000200675 753 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Lrriq1Q0P5X1 CT025603.1-201ENSMUST00000224040 448 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Lrriq1Q0P5X1 AC154305.2-201ENSMUST00000225813 901 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Lrriq1Q0P5X1 Krtap2-4-201ENSMUST00000074926 828 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lrriq1Q0P5X1 2310016G11Rik-201ENSMUST00000094460 992 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lrriq1Q0P5X1 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lrriq1Q0P5X1 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lrriq1Q0P5X1 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lrriq1Q0P5X1 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lrriq1Q0P5X1 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lrriq1Q0P5X1 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lrriq1Q0P5X1 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lrriq1Q0P5X1 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lrriq1Q0P5X1 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lrriq1Q0P5X1 E330034L11Rik-201ENSMUST00000200640 1742 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Lrriq1Q0P5X1 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lrriq1Q0P5X1 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lrriq1Q0P5X1 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lrriq1Q0P5X1 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lrriq1Q0P5X1 Gm13192-201ENSMUST00000101199 208 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Lrriq1Q0P5X1 Gm23769-201ENSMUST00000104441 121 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Lrriq1Q0P5X1 Gm10443-201ENSMUST00000119024 210 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Lrriq1Q0P5X1 Gm20568-201ENSMUST00000197129 208 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Lrriq1Q0P5X1 Pigx-212ENSMUST00000215073 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Lrriq1Q0P5X1 AC162938.2-202ENSMUST00000215497 722 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Lrriq1Q0P5X1 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Lrriq1Q0P5X1 Tex46-201ENSMUST00000046647 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Lrriq1Q0P5X1 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Lrriq1Q0P5X1 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Lrriq1Q0P5X1 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Lrriq1Q0P5X1 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Lrriq1Q0P5X1 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Lrriq1Q0P5X1 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Lrriq1Q0P5X1 Pemt-202ENSMUST00000102692 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Lrriq1Q0P5X1 C030013C21Rik-201ENSMUST00000133400 795 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Lrriq1Q0P5X1 Gm15911-201ENSMUST00000138992 809 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Lrriq1Q0P5X1 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
Lrriq1Q0P5X1 2610016A17Rik-201ENSMUST00000185211 474 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Lrriq1Q0P5X1 AC187103.3-201ENSMUST00000225725 646 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
Lrriq1Q0P5X1 AC118639.2-201ENSMUST00000226289 223 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
Lrriq1Q0P5X1 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Lrriq1Q0P5X1 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Lrriq1Q0P5X1 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Lrriq1Q0P5X1 Lexm-202ENSMUST00000106788 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Lrriq1Q0P5X1 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lrriq1Q0P5X1 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lrriq1Q0P5X1 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lrriq1Q0P5X1 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lrriq1Q0P5X1 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lrriq1Q0P5X1 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lrriq1Q0P5X1 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lrriq1Q0P5X1 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lrriq1Q0P5X1 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lrriq1Q0P5X1 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lrriq1Q0P5X1 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lrriq1Q0P5X1 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lrriq1Q0P5X1 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lrriq1Q0P5X1 Gm24294-201ENSMUST00000158295 277 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Lrriq1Q0P5X1 Tnnt1-206ENSMUST00000163710 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lrriq1Q0P5X1 Gm26875-201ENSMUST00000181006 950 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Lrriq1Q0P5X1 Calm5-202ENSMUST00000184271 423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lrriq1Q0P5X1 E230014E18Rik-201ENSMUST00000215920 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lrriq1Q0P5X1 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lrriq1Q0P5X1 Gm45218-201ENSMUST00000205533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lrriq1Q0P5X1 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lrriq1Q0P5X1 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lrriq1Q0P5X1 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lrriq1Q0P5X1 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lrriq1Q0P5X1 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lrriq1Q0P5X1 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lrriq1Q0P5X1 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lrriq1Q0P5X1 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lrriq1Q0P5X1 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lrriq1Q0P5X1 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lrriq1Q0P5X1 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Lrriq1Q0P5X1 Ighv1-74-201ENSMUST00000103543 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lrriq1Q0P5X1 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Lrriq1Q0P5X1 Ifitm1-202ENSMUST00000106040 560 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lrriq1Q0P5X1 Ifitm1-203ENSMUST00000106042 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lrriq1Q0P5X1 Nifk-202ENSMUST00000112688 849 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lrriq1Q0P5X1 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lrriq1Q0P5X1 Gm18010-201ENSMUST00000203553 202 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Lrriq1Q0P5X1 Ifitm1-201ENSMUST00000026564 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lrriq1Q0P5X1 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lrriq1Q0P5X1 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lrriq1Q0P5X1 Gm14005-210ENSMUST00000225087 1413 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Lrriq1Q0P5X1 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lrriq1Q0P5X1 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lrriq1Q0P5X1 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lrriq1Q0P5X1 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lrriq1Q0P5X1 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lrriq1Q0P5X1 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Lrriq1Q0P5X1 Mid1-ps1-201ENSMUST00000167967 1248 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.7 ms