Protein–RNA interactions for Protein: Q0GGX2

Znf541, Zinc finger protein 541, mousemouse

Predictions only

Length 1,363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf541Q0GGX2 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Znf541Q0GGX2 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Znf541Q0GGX2 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Znf541Q0GGX2 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Znf541Q0GGX2 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Znf541Q0GGX2 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Znf541Q0GGX2 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Znf541Q0GGX2 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Znf541Q0GGX2 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Znf541Q0GGX2 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Znf541Q0GGX2 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Znf541Q0GGX2 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Znf541Q0GGX2 Vmn1r38-201ENSMUST00000226457 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Znf541Q0GGX2 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Znf541Q0GGX2 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Znf541Q0GGX2 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Znf541Q0GGX2 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Znf541Q0GGX2 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Znf541Q0GGX2 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Znf541Q0GGX2 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Znf541Q0GGX2 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Znf541Q0GGX2 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Znf541Q0GGX2 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Znf541Q0GGX2 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Znf541Q0GGX2 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Znf541Q0GGX2 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Znf541Q0GGX2 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Znf541Q0GGX2 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Znf541Q0GGX2 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Znf541Q0GGX2 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Znf541Q0GGX2 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Znf541Q0GGX2 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Znf541Q0GGX2 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Znf541Q0GGX2 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Znf541Q0GGX2 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Znf541Q0GGX2 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Znf541Q0GGX2 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Znf541Q0GGX2 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Znf541Q0GGX2 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Znf541Q0GGX2 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Znf541Q0GGX2 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Znf541Q0GGX2 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Znf541Q0GGX2 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Znf541Q0GGX2 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Znf541Q0GGX2 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Znf541Q0GGX2 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Znf541Q0GGX2 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Znf541Q0GGX2 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Znf541Q0GGX2 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Znf541Q0GGX2 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Znf541Q0GGX2 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Znf541Q0GGX2 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Znf541Q0GGX2 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Znf541Q0GGX2 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Znf541Q0GGX2 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Znf541Q0GGX2 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Znf541Q0GGX2 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Znf541Q0GGX2 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Znf541Q0GGX2 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Znf541Q0GGX2 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Znf541Q0GGX2 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Znf541Q0GGX2 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Znf541Q0GGX2 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Znf541Q0GGX2 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Znf541Q0GGX2 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Znf541Q0GGX2 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Znf541Q0GGX2 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Znf541Q0GGX2 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Znf541Q0GGX2 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Znf541Q0GGX2 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Znf541Q0GGX2 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Znf541Q0GGX2 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Znf541Q0GGX2 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Znf541Q0GGX2 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Znf541Q0GGX2 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Znf541Q0GGX2 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Znf541Q0GGX2 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Znf541Q0GGX2 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Znf541Q0GGX2 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Znf541Q0GGX2 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Znf541Q0GGX2 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Znf541Q0GGX2 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Znf541Q0GGX2 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Znf541Q0GGX2 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Znf541Q0GGX2 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Znf541Q0GGX2 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Znf541Q0GGX2 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Znf541Q0GGX2 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Znf541Q0GGX2 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Znf541Q0GGX2 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Znf541Q0GGX2 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Znf541Q0GGX2 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Znf541Q0GGX2 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Znf541Q0GGX2 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Znf541Q0GGX2 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Znf541Q0GGX2 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Znf541Q0GGX2 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Znf541Q0GGX2 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Znf541Q0GGX2 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Znf541Q0GGX2 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms