Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Siah1bQ06985 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Siah1bQ06985 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Siah1bQ06985 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Siah1bQ06985 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Siah1bQ06985 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Siah1bQ06985 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Siah1bQ06985 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Siah1bQ06985 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Siah1bQ06985 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Siah1bQ06985 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Siah1bQ06985 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Siah1bQ06985 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Siah1bQ06985 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Siah1bQ06985 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Siah1bQ06985 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Siah1bQ06985 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Siah1bQ06985 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Siah1bQ06985 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Siah1bQ06985 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Siah1bQ06985 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Siah1bQ06985 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Siah1bQ06985 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Siah1bQ06985 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Siah1bQ06985 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Siah1bQ06985 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Siah1bQ06985 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Siah1bQ06985 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Siah1bQ06985 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Siah1bQ06985 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Siah1bQ06985 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Siah1bQ06985 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Siah1bQ06985 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Siah1bQ06985 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Siah1bQ06985 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Siah1bQ06985 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Siah1bQ06985 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Siah1bQ06985 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Siah1bQ06985 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Siah1bQ06985 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Siah1bQ06985 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Siah1bQ06985 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Siah1bQ06985 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Siah1bQ06985 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Siah1bQ06985 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Siah1bQ06985 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Siah1bQ06985 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Siah1bQ06985 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Siah1bQ06985 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Siah1bQ06985 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Siah1bQ06985 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Siah1bQ06985 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Siah1bQ06985 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Siah1bQ06985 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Siah1bQ06985 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Siah1bQ06985 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Siah1bQ06985 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Siah1bQ06985 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Siah1bQ06985 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Siah1bQ06985 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Siah1bQ06985 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Siah1bQ06985 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Siah1bQ06985 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Siah1bQ06985 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Siah1bQ06985 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Siah1bQ06985 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Siah1bQ06985 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Siah1bQ06985 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Siah1bQ06985 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Siah1bQ06985 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Siah1bQ06985 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Siah1bQ06985 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Siah1bQ06985 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Siah1bQ06985 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Siah1bQ06985 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Siah1bQ06985 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Siah1bQ06985 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Siah1bQ06985 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Siah1bQ06985 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Siah1bQ06985 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Siah1bQ06985 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Siah1bQ06985 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Siah1bQ06985 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Siah1bQ06985 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Siah1bQ06985 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Siah1bQ06985 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Siah1bQ06985 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Siah1bQ06985 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Siah1bQ06985 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Siah1bQ06985 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Siah1bQ06985 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Siah1bQ06985 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Siah1bQ06985 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Siah1bQ06985 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Siah1bQ06985 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Siah1bQ06985 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Siah1bQ06985 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Siah1bQ06985 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Siah1bQ06985 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Siah1bQ06985 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms