Protein–RNA interactions for Protein: Q03358

Msx2, Homeobox protein MSX-2, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx2Q03358 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Msx2Q03358 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Msx2Q03358 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Msx2Q03358 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Msx2Q03358 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Msx2Q03358 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC12.21□□□□□ -0.46
Msx2Q03358 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Msx2Q03358 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Msx2Q03358 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Msx2Q03358 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Msx2Q03358 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Msx2Q03358 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Msx2Q03358 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Msx2Q03358 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Msx2Q03358 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Msx2Q03358 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Msx2Q03358 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Msx2Q03358 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Msx2Q03358 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Msx2Q03358 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Msx2Q03358 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Msx2Q03358 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Msx2Q03358 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Msx2Q03358 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Msx2Q03358 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Msx2Q03358 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Msx2Q03358 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Msx2Q03358 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Msx2Q03358 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Msx2Q03358 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Msx2Q03358 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Msx2Q03358 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Msx2Q03358 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Msx2Q03358 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Msx2Q03358 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Msx2Q03358 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Msx2Q03358 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Msx2Q03358 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Msx2Q03358 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Msx2Q03358 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Msx2Q03358 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Msx2Q03358 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Msx2Q03358 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Msx2Q03358 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Msx2Q03358 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Msx2Q03358 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Msx2Q03358 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Msx2Q03358 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Msx2Q03358 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Msx2Q03358 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Msx2Q03358 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Msx2Q03358 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Msx2Q03358 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Msx2Q03358 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Msx2Q03358 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Msx2Q03358 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Msx2Q03358 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Msx2Q03358 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Msx2Q03358 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Msx2Q03358 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Msx2Q03358 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Msx2Q03358 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Msx2Q03358 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Msx2Q03358 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Msx2Q03358 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Msx2Q03358 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Msx2Q03358 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Msx2Q03358 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Msx2Q03358 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Msx2Q03358 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Msx2Q03358 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Msx2Q03358 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Msx2Q03358 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Msx2Q03358 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Msx2Q03358 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Msx2Q03358 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Msx2Q03358 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Msx2Q03358 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Msx2Q03358 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Msx2Q03358 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Msx2Q03358 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Msx2Q03358 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Msx2Q03358 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Msx2Q03358 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Msx2Q03358 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Msx2Q03358 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Msx2Q03358 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Msx2Q03358 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Msx2Q03358 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Msx2Q03358 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Msx2Q03358 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Msx2Q03358 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Msx2Q03358 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Msx2Q03358 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Msx2Q03358 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Msx2Q03358 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Msx2Q03358 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Msx2Q03358 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Msx2Q03358 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Msx2Q03358 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 125.6 ms