Protein–RNA interactions for Protein: Q03350

Thbs2, Thrombospondin-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs2Q03350 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Thbs2Q03350 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Thbs2Q03350 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Thbs2Q03350 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Thbs2Q03350 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Thbs2Q03350 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Thbs2Q03350 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Thbs2Q03350 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Thbs2Q03350 Gm28196-201ENSMUST00000187719 640 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Thbs2Q03350 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Thbs2Q03350 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Thbs2Q03350 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Thbs2Q03350 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Thbs2Q03350 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Thbs2Q03350 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Thbs2Q03350 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Thbs2Q03350 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Thbs2Q03350 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Thbs2Q03350 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Thbs2Q03350 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Thbs2Q03350 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Thbs2Q03350 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Thbs2Q03350 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Thbs2Q03350 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Thbs2Q03350 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Thbs2Q03350 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Thbs2Q03350 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Thbs2Q03350 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Thbs2Q03350 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Thbs2Q03350 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Thbs2Q03350 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Thbs2Q03350 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Thbs2Q03350 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Thbs2Q03350 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Thbs2Q03350 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Thbs2Q03350 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Thbs2Q03350 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Thbs2Q03350 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Thbs2Q03350 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Thbs2Q03350 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Thbs2Q03350 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Thbs2Q03350 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Thbs2Q03350 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Thbs2Q03350 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Thbs2Q03350 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Thbs2Q03350 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Thbs2Q03350 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Thbs2Q03350 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Thbs2Q03350 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Thbs2Q03350 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Thbs2Q03350 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Thbs2Q03350 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Thbs2Q03350 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Thbs2Q03350 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Thbs2Q03350 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Thbs2Q03350 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Thbs2Q03350 Gm19087-201ENSMUST00000191430 946 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Thbs2Q03350 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Thbs2Q03350 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Thbs2Q03350 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Thbs2Q03350 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Thbs2Q03350 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Thbs2Q03350 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Thbs2Q03350 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Thbs2Q03350 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Thbs2Q03350 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Thbs2Q03350 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Thbs2Q03350 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Thbs2Q03350 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Thbs2Q03350 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Thbs2Q03350 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Thbs2Q03350 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Thbs2Q03350 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Thbs2Q03350 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Thbs2Q03350 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Thbs2Q03350 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Thbs2Q03350 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Thbs2Q03350 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Thbs2Q03350 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Thbs2Q03350 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Thbs2Q03350 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Thbs2Q03350 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Thbs2Q03350 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Thbs2Q03350 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Thbs2Q03350 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Thbs2Q03350 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Thbs2Q03350 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Thbs2Q03350 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Thbs2Q03350 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Thbs2Q03350 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Thbs2Q03350 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Thbs2Q03350 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Thbs2Q03350 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Thbs2Q03350 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Thbs2Q03350 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Thbs2Q03350 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Thbs2Q03350 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Thbs2Q03350 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Thbs2Q03350 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Thbs2Q03350 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 108.4 ms