Protein–RNA interactions for Protein: Q02789

Cacna1s, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, mousemouse

Predictions only

Length 1,880 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1sQ02789 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cacna1sQ02789 Gm23105-201ENSMUST00000083719 134 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cacna1sQ02789 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cacna1sQ02789 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cacna1sQ02789 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cacna1sQ02789 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cacna1sQ02789 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cacna1sQ02789 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cacna1sQ02789 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cacna1sQ02789 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cacna1sQ02789 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cacna1sQ02789 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cacna1sQ02789 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cacna1sQ02789 Gm12179-201ENSMUST00000118344 1272 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cacna1sQ02789 Gm13117-201ENSMUST00000120894 691 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cacna1sQ02789 Gm13166-201ENSMUST00000123828 940 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cacna1sQ02789 Gm13236-201ENSMUST00000153010 940 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cacna1sQ02789 Gm24248-201ENSMUST00000157321 322 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cacna1sQ02789 Gm15524-201ENSMUST00000159874 463 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cacna1sQ02789 Pla2g1b-201ENSMUST00000031495 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cacna1sQ02789 BC049762-202ENSMUST00000065950 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cacna1sQ02789 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cacna1sQ02789 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cacna1sQ02789 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cacna1sQ02789 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cacna1sQ02789 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cacna1sQ02789 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cacna1sQ02789 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cacna1sQ02789 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cacna1sQ02789 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cacna1sQ02789 Gm11502-201ENSMUST00000120917 1211 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cacna1sQ02789 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cacna1sQ02789 Ly6e-207ENSMUST00000187606 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cacna1sQ02789 Gm9884-201ENSMUST00000194343 1222 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cacna1sQ02789 Gm34312-201ENSMUST00000204650 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cacna1sQ02789 Gm44507-201ENSMUST00000206249 343 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cacna1sQ02789 Gm45613-201ENSMUST00000210718 443 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cacna1sQ02789 Gm30671-201ENSMUST00000214898 318 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cacna1sQ02789 Gm40761-201ENSMUST00000219123 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cacna1sQ02789 AC158388.3-202ENSMUST00000225517 775 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cacna1sQ02789 AC130477.1-201ENSMUST00000226982 420 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cacna1sQ02789 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cacna1sQ02789 Krtap4-13-201ENSMUST00000050106 815 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cacna1sQ02789 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cacna1sQ02789 n-R5s185-201ENSMUST00000083953 119 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cacna1sQ02789 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cacna1sQ02789 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cacna1sQ02789 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cacna1sQ02789 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cacna1sQ02789 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cacna1sQ02789 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cacna1sQ02789 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cacna1sQ02789 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cacna1sQ02789 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cacna1sQ02789 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cacna1sQ02789 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cacna1sQ02789 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cacna1sQ02789 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Cacna1sQ02789 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cacna1sQ02789 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cacna1sQ02789 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cacna1sQ02789 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cacna1sQ02789 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cacna1sQ02789 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacna1sQ02789 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacna1sQ02789 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacna1sQ02789 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacna1sQ02789 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacna1sQ02789 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacna1sQ02789 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacna1sQ02789 C1qtnf7-202ENSMUST00000121872 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacna1sQ02789 Gm11789-203ENSMUST00000140645 737 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacna1sQ02789 Mrpl20-206ENSMUST00000185148 494 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacna1sQ02789 Gm37852-201ENSMUST00000193027 350 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacna1sQ02789 Chmp3-202ENSMUST00000065364 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacna1sQ02789 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacna1sQ02789 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacna1sQ02789 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacna1sQ02789 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacna1sQ02789 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacna1sQ02789 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacna1sQ02789 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacna1sQ02789 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacna1sQ02789 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacna1sQ02789 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacna1sQ02789 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacna1sQ02789 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacna1sQ02789 S100a4-201ENSMUST00000001046 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacna1sQ02789 Gm11244-201ENSMUST00000121243 237 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacna1sQ02789 Gm16553-201ENSMUST00000160490 716 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacna1sQ02789 B230110C06Rik-201ENSMUST00000181388 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacna1sQ02789 Gm7719-201ENSMUST00000182374 975 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacna1sQ02789 Gm7082-201ENSMUST00000209880 969 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacna1sQ02789 Olfr692-202ENSMUST00000217827 1126 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacna1sQ02789 Olfr692-201ENSMUST00000098152 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacna1sQ02789 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacna1sQ02789 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacna1sQ02789 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacna1sQ02789 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacna1sQ02789 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.2 ms