Protein–RNA interactions for Protein: Q01149

Col1a2, Collagen alpha-2(I) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col1a2Q01149 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Col1a2Q01149 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Col1a2Q01149 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Col1a2Q01149 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Col1a2Q01149 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Col1a2Q01149 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Col1a2Q01149 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Col1a2Q01149 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Col1a2Q01149 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Col1a2Q01149 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Col1a2Q01149 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Col1a2Q01149 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Col1a2Q01149 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col1a2Q01149 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col1a2Q01149 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Col1a2Q01149 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col1a2Q01149 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col1a2Q01149 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Col1a2Q01149 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col1a2Q01149 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col1a2Q01149 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col1a2Q01149 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col1a2Q01149 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col1a2Q01149 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col1a2Q01149 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col1a2Q01149 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col1a2Q01149 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col1a2Q01149 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col1a2Q01149 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col1a2Q01149 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col1a2Q01149 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col1a2Q01149 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col1a2Q01149 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col1a2Q01149 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col1a2Q01149 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col1a2Q01149 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col1a2Q01149 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col1a2Q01149 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col1a2Q01149 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col1a2Q01149 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col1a2Q01149 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col1a2Q01149 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col1a2Q01149 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col1a2Q01149 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col1a2Q01149 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col1a2Q01149 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col1a2Q01149 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col1a2Q01149 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Col1a2Q01149 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col1a2Q01149 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col1a2Q01149 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col1a2Q01149 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col1a2Q01149 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col1a2Q01149 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col1a2Q01149 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col1a2Q01149 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col1a2Q01149 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col1a2Q01149 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col1a2Q01149 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col1a2Q01149 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col1a2Q01149 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col1a2Q01149 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col1a2Q01149 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col1a2Q01149 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col1a2Q01149 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col1a2Q01149 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col1a2Q01149 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col1a2Q01149 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col1a2Q01149 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Col1a2Q01149 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col1a2Q01149 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col1a2Q01149 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col1a2Q01149 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col1a2Q01149 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Col1a2Q01149 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Col1a2Q01149 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col1a2Q01149 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col1a2Q01149 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col1a2Q01149 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Col1a2Q01149 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Col1a2Q01149 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Col1a2Q01149 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col1a2Q01149 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Col1a2Q01149 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Col1a2Q01149 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Col1a2Q01149 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col1a2Q01149 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col1a2Q01149 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col1a2Q01149 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col1a2Q01149 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col1a2Q01149 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col1a2Q01149 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col1a2Q01149 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col1a2Q01149 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Col1a2Q01149 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col1a2Q01149 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col1a2Q01149 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col1a2Q01149 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col1a2Q01149 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col1a2Q01149 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.2 ms