Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC8.87□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC8.87□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.87□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC8.87□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC8.87□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.87□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Armcx4-201ENSMUST00000124226 7996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC8.86□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC8.86□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Gon4l-203ENSMUST00000107498 7537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms