Protein–RNA interactions for Protein: Q00724

Rbp4, Retinol-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp4Q00724 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rbp4Q00724 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rbp4Q00724 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rbp4Q00724 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rbp4Q00724 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rbp4Q00724 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rbp4Q00724 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
Rbp4Q00724 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rbp4Q00724 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rbp4Q00724 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rbp4Q00724 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rbp4Q00724 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rbp4Q00724 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rbp4Q00724 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rbp4Q00724 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rbp4Q00724 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rbp4Q00724 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rbp4Q00724 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rbp4Q00724 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rbp4Q00724 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rbp4Q00724 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rbp4Q00724 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rbp4Q00724 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rbp4Q00724 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rbp4Q00724 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rbp4Q00724 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rbp4Q00724 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rbp4Q00724 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rbp4Q00724 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rbp4Q00724 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Rbp4Q00724 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Rbp4Q00724 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rbp4Q00724 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Rbp4Q00724 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rbp4Q00724 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Rbp4Q00724 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rbp4Q00724 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rbp4Q00724 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rbp4Q00724 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rbp4Q00724 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Rbp4Q00724 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Rbp4Q00724 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rbp4Q00724 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rbp4Q00724 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rbp4Q00724 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rbp4Q00724 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rbp4Q00724 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Rbp4Q00724 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rbp4Q00724 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rbp4Q00724 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rbp4Q00724 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rbp4Q00724 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rbp4Q00724 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rbp4Q00724 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rbp4Q00724 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rbp4Q00724 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Rbp4Q00724 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rbp4Q00724 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rbp4Q00724 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rbp4Q00724 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rbp4Q00724 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rbp4Q00724 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rbp4Q00724 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rbp4Q00724 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rbp4Q00724 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rbp4Q00724 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rbp4Q00724 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rbp4Q00724 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rbp4Q00724 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rbp4Q00724 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rbp4Q00724 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rbp4Q00724 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rbp4Q00724 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rbp4Q00724 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rbp4Q00724 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rbp4Q00724 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Rbp4Q00724 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Rbp4Q00724 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rbp4Q00724 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rbp4Q00724 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rbp4Q00724 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rbp4Q00724 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Rbp4Q00724 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Rbp4Q00724 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Rbp4Q00724 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rbp4Q00724 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Rbp4Q00724 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Rbp4Q00724 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rbp4Q00724 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rbp4Q00724 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rbp4Q00724 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rbp4Q00724 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rbp4Q00724 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rbp4Q00724 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rbp4Q00724 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rbp4Q00724 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rbp4Q00724 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rbp4Q00724 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rbp4Q00724 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rbp4Q00724 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms