Protein–RNA interactions for Protein: P97785

Gfra1, GDNF family receptor alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra1P97785 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gfra1P97785 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gfra1P97785 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gfra1P97785 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gfra1P97785 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gfra1P97785 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gfra1P97785 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gfra1P97785 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gfra1P97785 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gfra1P97785 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gfra1P97785 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gfra1P97785 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gfra1P97785 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gfra1P97785 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gfra1P97785 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gfra1P97785 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gfra1P97785 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gfra1P97785 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gfra1P97785 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gfra1P97785 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gfra1P97785 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gfra1P97785 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gfra1P97785 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gfra1P97785 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gfra1P97785 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gfra1P97785 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gfra1P97785 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gfra1P97785 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gfra1P97785 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gfra1P97785 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gfra1P97785 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gfra1P97785 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gfra1P97785 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gfra1P97785 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gfra1P97785 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gfra1P97785 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gfra1P97785 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gfra1P97785 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gfra1P97785 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gfra1P97785 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gfra1P97785 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gfra1P97785 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gfra1P97785 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gfra1P97785 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Gfra1P97785 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gfra1P97785 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gfra1P97785 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gfra1P97785 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Gfra1P97785 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Gfra1P97785 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gfra1P97785 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Gfra1P97785 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gfra1P97785 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Gfra1P97785 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Gfra1P97785 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gfra1P97785 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gfra1P97785 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gfra1P97785 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gfra1P97785 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gfra1P97785 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gfra1P97785 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gfra1P97785 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gfra1P97785 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gfra1P97785 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gfra1P97785 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gfra1P97785 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gfra1P97785 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gfra1P97785 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gfra1P97785 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gfra1P97785 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gfra1P97785 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gfra1P97785 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gfra1P97785 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gfra1P97785 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gfra1P97785 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gfra1P97785 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Gfra1P97785 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gfra1P97785 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gfra1P97785 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gfra1P97785 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gfra1P97785 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gfra1P97785 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gfra1P97785 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gfra1P97785 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gfra1P97785 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gfra1P97785 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gfra1P97785 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gfra1P97785 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gfra1P97785 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gfra1P97785 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gfra1P97785 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gfra1P97785 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gfra1P97785 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gfra1P97785 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gfra1P97785 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gfra1P97785 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gfra1P97785 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gfra1P97785 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gfra1P97785 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gfra1P97785 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms