Protein–RNA interactions for Protein: P84244

H3f3a, Histone H3.3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3f3aP84244 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
H3f3aP84244 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
H3f3aP84244 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
H3f3aP84244 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
H3f3aP84244 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
H3f3aP84244 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
H3f3aP84244 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
H3f3aP84244 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
H3f3aP84244 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
H3f3aP84244 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
H3f3aP84244 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
H3f3aP84244 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
H3f3aP84244 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
H3f3aP84244 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
H3f3aP84244 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
H3f3aP84244 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
H3f3aP84244 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
H3f3aP84244 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
H3f3aP84244 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
H3f3aP84244 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
H3f3aP84244 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
H3f3aP84244 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
H3f3aP84244 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
H3f3aP84244 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
H3f3aP84244 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
H3f3aP84244 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
H3f3aP84244 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
H3f3aP84244 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
H3f3aP84244 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
H3f3aP84244 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
H3f3aP84244 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
H3f3aP84244 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
H3f3aP84244 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
H3f3aP84244 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
H3f3aP84244 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
H3f3aP84244 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
H3f3aP84244 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
H3f3aP84244 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
H3f3aP84244 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
H3f3aP84244 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
H3f3aP84244 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
H3f3aP84244 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
H3f3aP84244 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
H3f3aP84244 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
H3f3aP84244 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
H3f3aP84244 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
H3f3aP84244 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
H3f3aP84244 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
H3f3aP84244 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
H3f3aP84244 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
H3f3aP84244 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
H3f3aP84244 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
H3f3aP84244 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
H3f3aP84244 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
H3f3aP84244 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
H3f3aP84244 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
H3f3aP84244 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
H3f3aP84244 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
H3f3aP84244 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
H3f3aP84244 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
H3f3aP84244 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
H3f3aP84244 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
H3f3aP84244 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms