Protein–RNA interactions for Protein: P81066

Irx2, Iroquois-class homeodomain protein IRX-2, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx2P81066 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Irx2P81066 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Irx2P81066 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Irx2P81066 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Irx2P81066 4930432K21Rik-202ENSMUST00000118856 2366 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Irx2P81066 Gnl2-201ENSMUST00000030684 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Irx2P81066 Krt75-201ENSMUST00000042957 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Irx2P81066 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Irx2P81066 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Irx2P81066 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Irx2P81066 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Irx2P81066 B3glct-201ENSMUST00000100404 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Irx2P81066 Zfp36-201ENSMUST00000051241 2790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Irx2P81066 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Irx2P81066 Tmcc2-201ENSMUST00000045473 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Irx2P81066 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Irx2P81066 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Irx2P81066 Ccdc136-208ENSMUST00000180829 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Irx2P81066 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Irx2P81066 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Irx2P81066 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Irx2P81066 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Irx2P81066 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Irx2P81066 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Irx2P81066 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Irx2P81066 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Irx2P81066 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Irx2P81066 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Irx2P81066 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Irx2P81066 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Irx2P81066 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Irx2P81066 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Irx2P81066 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Irx2P81066 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Irx2P81066 Atf7ip2-201ENSMUST00000044005 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Irx2P81066 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Irx2P81066 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Irx2P81066 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Irx2P81066 Gm10463-202ENSMUST00000195772 2889 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Irx2P81066 Gm26737-201ENSMUST00000181106 2151 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Irx2P81066 Piwil1-201ENSMUST00000086056 4016 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Irx2P81066 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Irx2P81066 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Irx2P81066 Satb1-207ENSMUST00000140979 3748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Irx2P81066 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Irx2P81066 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Irx2P81066 C730027H18Rik-201ENSMUST00000218381 2300 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Irx2P81066 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Irx2P81066 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Irx2P81066 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Irx2P81066 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Irx2P81066 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Irx2P81066 Usp2-203ENSMUST00000114830 2122 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Irx2P81066 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Irx2P81066 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Irx2P81066 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Irx2P81066 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Irx2P81066 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Irx2P81066 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Irx2P81066 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Irx2P81066 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Irx2P81066 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Irx2P81066 Gm10684-201ENSMUST00000098827 2203 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Irx2P81066 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Irx2P81066 Fmod-201ENSMUST00000048183 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Irx2P81066 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Irx2P81066 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Irx2P81066 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Irx2P81066 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Irx2P81066 Bace2-201ENSMUST00000047275 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Irx2P81066 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Irx2P81066 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Irx2P81066 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Irx2P81066 Ablim2-206ENSMUST00000114206 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Irx2P81066 Gm26631-201ENSMUST00000181462 2505 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Irx2P81066 CT868720.1-201ENSMUST00000223069 2544 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Irx2P81066 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Irx2P81066 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Irx2P81066 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Irx2P81066 Dync1i2-201ENSMUST00000081710 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Irx2P81066 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Irx2P81066 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Irx2P81066 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Irx2P81066 Epn3-202ENSMUST00000127305 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Irx2P81066 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Irx2P81066 Gm37333-201ENSMUST00000192904 2251 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
Irx2P81066 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Irx2P81066 Glt1d1-201ENSMUST00000118139 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Irx2P81066 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Irx2P81066 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Irx2P81066 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Irx2P81066 Gm40617-201ENSMUST00000218840 2420 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Irx2P81066 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Irx2P81066 Gm45828-201ENSMUST00000206938 1836 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Irx2P81066 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Irx2P81066 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Irx2P81066 Mms19-201ENSMUST00000026168 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Irx2P81066 Abcf1-201ENSMUST00000043757 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Irx2P81066 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Irx2P81066 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms