Protein–RNA interactions for Protein: P70399

Tp53bp1, TP53-binding protein 1, mousemouse

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Length 1,969 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tp53bp1P70399 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tp53bp1P70399 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tp53bp1P70399 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tp53bp1P70399 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tp53bp1P70399 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tp53bp1P70399 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tp53bp1P70399 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tp53bp1P70399 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tp53bp1P70399 Rps9-204ENSMUST00000108625 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tp53bp1P70399 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tp53bp1P70399 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tp53bp1P70399 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Tp53bp1P70399 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Tp53bp1P70399 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Tp53bp1P70399 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tp53bp1P70399 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tp53bp1P70399 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tp53bp1P70399 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Tp53bp1P70399 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tp53bp1P70399 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tp53bp1P70399 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tp53bp1P70399 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tp53bp1P70399 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Tp53bp1P70399 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tp53bp1P70399 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tp53bp1P70399 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tp53bp1P70399 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tp53bp1P70399 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tp53bp1P70399 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tp53bp1P70399 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tp53bp1P70399 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tp53bp1P70399 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tp53bp1P70399 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tp53bp1P70399 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tp53bp1P70399 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tp53bp1P70399 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tp53bp1P70399 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tp53bp1P70399 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tp53bp1P70399 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tp53bp1P70399 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tp53bp1P70399 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tp53bp1P70399 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Tp53bp1P70399 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tp53bp1P70399 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tp53bp1P70399 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tp53bp1P70399 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tp53bp1P70399 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tp53bp1P70399 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Tp53bp1P70399 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tp53bp1P70399 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tp53bp1P70399 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tp53bp1P70399 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tp53bp1P70399 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tp53bp1P70399 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tp53bp1P70399 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tp53bp1P70399 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tp53bp1P70399 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tp53bp1P70399 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Tp53bp1P70399 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tp53bp1P70399 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Tp53bp1P70399 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tp53bp1P70399 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tp53bp1P70399 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tp53bp1P70399 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tp53bp1P70399 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tp53bp1P70399 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tp53bp1P70399 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tp53bp1P70399 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tp53bp1P70399 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Tp53bp1P70399 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Tp53bp1P70399 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tp53bp1P70399 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tp53bp1P70399 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tp53bp1P70399 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tp53bp1P70399 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tp53bp1P70399 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Tp53bp1P70399 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tp53bp1P70399 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tp53bp1P70399 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tp53bp1P70399 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tp53bp1P70399 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tp53bp1P70399 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tp53bp1P70399 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tp53bp1P70399 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Tp53bp1P70399 Gm4993-201ENSMUST00000118719 1174 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Tp53bp1P70399 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tp53bp1P70399 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tp53bp1P70399 AC127270.1-201ENSMUST00000221441 491 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
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