Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SbdsP70122 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SbdsP70122 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SbdsP70122 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SbdsP70122 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SbdsP70122 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SbdsP70122 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SbdsP70122 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SbdsP70122 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SbdsP70122 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SbdsP70122 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SbdsP70122 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SbdsP70122 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SbdsP70122 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SbdsP70122 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SbdsP70122 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SbdsP70122 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SbdsP70122 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SbdsP70122 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SbdsP70122 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SbdsP70122 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SbdsP70122 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SbdsP70122 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SbdsP70122 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SbdsP70122 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SbdsP70122 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SbdsP70122 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SbdsP70122 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SbdsP70122 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SbdsP70122 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SbdsP70122 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SbdsP70122 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SbdsP70122 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SbdsP70122 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SbdsP70122 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SbdsP70122 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SbdsP70122 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SbdsP70122 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SbdsP70122 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SbdsP70122 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SbdsP70122 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SbdsP70122 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SbdsP70122 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SbdsP70122 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SbdsP70122 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SbdsP70122 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SbdsP70122 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SbdsP70122 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SbdsP70122 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SbdsP70122 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SbdsP70122 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SbdsP70122 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SbdsP70122 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SbdsP70122 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SbdsP70122 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SbdsP70122 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SbdsP70122 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SbdsP70122 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SbdsP70122 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SbdsP70122 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SbdsP70122 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SbdsP70122 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SbdsP70122 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SbdsP70122 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SbdsP70122 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SbdsP70122 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SbdsP70122 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SbdsP70122 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SbdsP70122 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SbdsP70122 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SbdsP70122 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SbdsP70122 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SbdsP70122 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SbdsP70122 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SbdsP70122 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SbdsP70122 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SbdsP70122 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SbdsP70122 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SbdsP70122 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SbdsP70122 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SbdsP70122 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SbdsP70122 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SbdsP70122 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SbdsP70122 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SbdsP70122 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SbdsP70122 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SbdsP70122 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SbdsP70122 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SbdsP70122 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SbdsP70122 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SbdsP70122 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SbdsP70122 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SbdsP70122 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SbdsP70122 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SbdsP70122 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SbdsP70122 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SbdsP70122 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SbdsP70122 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SbdsP70122 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SbdsP70122 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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