Protein–RNA interactions for Protein: P63166

Sumo1, Small ubiquitin-related modifier 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sumo1P63166 4930551O13Rik-201ENSMUST00000145585 1065 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sumo1P63166 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Sumo1P63166 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Sumo1P63166 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Sumo1P63166 Gm34816-201ENSMUST00000193363 502 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sumo1P63166 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Sumo1P63166 6330419E04Rik-201ENSMUST00000203087 1263 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Sumo1P63166 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sumo1P63166 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Sumo1P63166 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Sumo1P63166 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sumo1P63166 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sumo1P63166 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Sumo1P63166 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Sumo1P63166 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sumo1P63166 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sumo1P63166 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Sumo1P63166 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sumo1P63166 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sumo1P63166 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sumo1P63166 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Sumo1P63166 Il6st-201ENSMUST00000070731 5207 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Sumo1P63166 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sumo1P63166 Piezo2-202ENSMUST00000047480 10724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sumo1P63166 Thsd4-206ENSMUST00000171654 8522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Sumo1P63166 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sumo1P63166 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sumo1P63166 Smarca2-209ENSMUST00000176030 5862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Sumo1P63166 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sumo1P63166 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Sumo1P63166 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Sumo1P63166 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sumo1P63166 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sumo1P63166 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Sumo1P63166 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sumo1P63166 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sumo1P63166 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sumo1P63166 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sumo1P63166 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sumo1P63166 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sumo1P63166 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sumo1P63166 Phactr1-213ENSMUST00000148891 5307 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sumo1P63166 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sumo1P63166 Zbtb21-201ENSMUST00000052089 5410 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sumo1P63166 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sumo1P63166 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sumo1P63166 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sumo1P63166 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sumo1P63166 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sumo1P63166 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sumo1P63166 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sumo1P63166 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sumo1P63166 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sumo1P63166 Phf11b-201ENSMUST00000166121 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sumo1P63166 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sumo1P63166 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Sumo1P63166 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sumo1P63166 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sumo1P63166 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Sumo1P63166 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Sumo1P63166 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sumo1P63166 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Sumo1P63166 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Sumo1P63166 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sumo1P63166 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sumo1P63166 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sumo1P63166 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sumo1P63166 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sumo1P63166 BC028528-202ENSMUST00000090476 809 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sumo1P63166 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sumo1P63166 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sumo1P63166 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sumo1P63166 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sumo1P63166 0610040B10Rik-203ENSMUST00000198455 1643 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Sumo1P63166 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sumo1P63166 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sumo1P63166 Myh8-201ENSMUST00000019625 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sumo1P63166 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sumo1P63166 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sumo1P63166 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sumo1P63166 Epb41l1-201ENSMUST00000029155 6220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sumo1P63166 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sumo1P63166 Nipbl-201ENSMUST00000052965 8815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sumo1P63166 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sumo1P63166 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sumo1P63166 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sumo1P63166 Raph1-204ENSMUST00000140485 10024 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sumo1P63166 Lhx9-205ENSMUST00000112030 4633 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sumo1P63166 Nos1-206ENSMUST00000142742 10123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sumo1P63166 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sumo1P63166 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sumo1P63166 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sumo1P63166 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sumo1P63166 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sumo1P63166 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Sumo1P63166 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sumo1P63166 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sumo1P63166 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sumo1P63166 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sumo1P63166 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms