Protein–RNA interactions for Protein: P62858

Rps28, 40S ribosomal protein S28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 69 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps28P62858 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Sept9-205ENSMUST00000106354 3869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Zfp324-201ENSMUST00000038701 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Ccdc148-204ENSMUST00000226455 4612 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Olfr376-202ENSMUST00000120401 3342 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Cd300lg-203ENSMUST00000107164 2737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Rps28P62858 5430419D17Rik-203ENSMUST00000208921 7948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Ccdc136-207ENSMUST00000154619 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Gm10425-201ENSMUST00000181085 3364 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Dnajb12-204ENSMUST00000146590 3070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Lhx9-201ENSMUST00000019374 4937 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Gm28945-201ENSMUST00000187780 2165 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Gm29622-201ENSMUST00000190914 2165 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Krt222-201ENSMUST00000038214 2042 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rps28P62858 4930512J16Rik-201ENSMUST00000203704 1859 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Slc45a4-207ENSMUST00000151288 7509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Gadl1-202ENSMUST00000119291 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Gm16536-201ENSMUST00000162209 1589 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Apobec4-201ENSMUST00000068875 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Kirrel3-208ENSMUST00000188933 3643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Dync1i1-201ENSMUST00000115554 2518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Pip5k1a-201ENSMUST00000005768 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Tnc-203ENSMUST00000107372 7106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Dpf2-205ENSMUST00000136983 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Tmem255a-202ENSMUST00000089054 3311 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Gpa33-204ENSMUST00000166860 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rps28P62858 CT010462.1-202ENSMUST00000222225 2225 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Vwa5b1-201ENSMUST00000030533 7486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Heatr4-201ENSMUST00000164935 3038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Hbb-y-201ENSMUST00000033229 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Erc2-201ENSMUST00000090302 6083 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Akap12-202ENSMUST00000215696 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Zfp185-201ENSMUST00000114546 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Itsn2-211ENSMUST00000219007 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rps28P62858 AC125409.1-201ENSMUST00000223213 3370 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Zfhx3-201ENSMUST00000043896 16433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Kcnk2-201ENSMUST00000079451 3297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Pard3-213ENSMUST00000160766 4949 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Lamb1-201ENSMUST00000002979 5784 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Hpgds-201ENSMUST00000031982 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Caps2-201ENSMUST00000092176 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Mybpc3-201ENSMUST00000111430 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Slc26a1-202ENSMUST00000119270 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Slc26a1-204ENSMUST00000163328 3015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Sh3bgrl-201ENSMUST00000033598 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rps28P62858 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rps28P62858 AC168276.1-201ENSMUST00000218963 2385 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rps28P62858 A830018L16Rik-203ENSMUST00000137824 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Gm26614-201ENSMUST00000180386 3909 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Pfkfb3-216ENSMUST00000191668 2216 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Ank2-214ENSMUST00000182547 2428 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Zfp873-203ENSMUST00000209622 2284 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Fam161a-201ENSMUST00000058269 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Ppp2r2a-201ENSMUST00000089230 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Fer1l5-202ENSMUST00000179162 6315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Inpp5j-201ENSMUST00000044507 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Mtmr7-205ENSMUST00000174205 2679 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Mid1-202ENSMUST00000078947 3591 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Rps28P62858 BC005624-201ENSMUST00000028205 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Rps28P62858 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Rps28P62858 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Rps28P62858 Tns1-208ENSMUST00000187584 9916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Rps28P62858 Ctage5-201ENSMUST00000021384 1628 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Rps28P62858 Ncoa7-210ENSMUST00000217138 2192 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Rps28P62858 AC117245.3-201ENSMUST00000217495 2176 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Rps28P62858 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Rps28P62858 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Rps28P62858 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Rps28P62858 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Rps28P62858 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Rps28P62858 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Rps28P62858 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Rps28P62858 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Rps28P62858 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms