Protein–RNA interactions for Protein: P62823

Rab3c, Ras-related protein Rab-3C, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3cP62823 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rab3cP62823 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rab3cP62823 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rab3cP62823 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rab3cP62823 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rab3cP62823 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rab3cP62823 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rab3cP62823 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rab3cP62823 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rab3cP62823 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rab3cP62823 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rab3cP62823 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rab3cP62823 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rab3cP62823 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rab3cP62823 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rab3cP62823 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rab3cP62823 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rab3cP62823 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rab3cP62823 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rab3cP62823 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rab3cP62823 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Rab3cP62823 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rab3cP62823 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rab3cP62823 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rab3cP62823 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Rab3cP62823 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rab3cP62823 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Rab3cP62823 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rab3cP62823 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rab3cP62823 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rab3cP62823 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rab3cP62823 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rab3cP62823 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rab3cP62823 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rab3cP62823 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Rab3cP62823 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rab3cP62823 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rab3cP62823 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rab3cP62823 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Rab3cP62823 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Rab3cP62823 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rab3cP62823 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rab3cP62823 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rab3cP62823 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rab3cP62823 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rab3cP62823 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rab3cP62823 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rab3cP62823 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rab3cP62823 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rab3cP62823 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rab3cP62823 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rab3cP62823 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rab3cP62823 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rab3cP62823 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rab3cP62823 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Rab3cP62823 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rab3cP62823 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rab3cP62823 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rab3cP62823 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Rab3cP62823 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rab3cP62823 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rab3cP62823 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rab3cP62823 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rab3cP62823 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rab3cP62823 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rab3cP62823 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rab3cP62823 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rab3cP62823 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rab3cP62823 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rab3cP62823 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rab3cP62823 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rab3cP62823 Gm5124-202ENSMUST00000132683 2083 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Rab3cP62823 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rab3cP62823 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Rab3cP62823 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rab3cP62823 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rab3cP62823 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rab3cP62823 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rab3cP62823 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rab3cP62823 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rab3cP62823 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rab3cP62823 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rab3cP62823 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rab3cP62823 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rab3cP62823 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rab3cP62823 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rab3cP62823 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rab3cP62823 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rab3cP62823 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rab3cP62823 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rab3cP62823 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rab3cP62823 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rab3cP62823 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rab3cP62823 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rab3cP62823 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Rab3cP62823 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC10.71□□□□□ -0.7
Rab3cP62823 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Rab3cP62823 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Rab3cP62823 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Rab3cP62823 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms