Protein–RNA interactions for Protein: P61969

Lmo4, LIM domain transcription factor LMO4, mousemouse

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Length 165 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo4P61969 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Lmo4P61969 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Lmo4P61969 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Lmo4P61969 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Lmo4P61969 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Lmo4P61969 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Lmo4P61969 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Lmo4P61969 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Lmo4P61969 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lmo4P61969 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lmo4P61969 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lmo4P61969 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lmo4P61969 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lmo4P61969 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lmo4P61969 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lmo4P61969 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lmo4P61969 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lmo4P61969 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lmo4P61969 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lmo4P61969 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lmo4P61969 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lmo4P61969 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lmo4P61969 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lmo4P61969 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lmo4P61969 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Lmo4P61969 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Lmo4P61969 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Lmo4P61969 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Lmo4P61969 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lmo4P61969 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lmo4P61969 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lmo4P61969 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lmo4P61969 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Lmo4P61969 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Lmo4P61969 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lmo4P61969 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lmo4P61969 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lmo4P61969 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lmo4P61969 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lmo4P61969 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lmo4P61969 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lmo4P61969 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lmo4P61969 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lmo4P61969 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Lmo4P61969 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lmo4P61969 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lmo4P61969 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lmo4P61969 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lmo4P61969 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lmo4P61969 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lmo4P61969 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lmo4P61969 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lmo4P61969 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lmo4P61969 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lmo4P61969 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lmo4P61969 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lmo4P61969 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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