Protein–RNA interactions for Protein: P58686

UPF0184 protein C9orf16 homolog, mousemouse

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Length 83 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P58686 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P58686 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P58686 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
P58686 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P58686 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
P58686 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
P58686 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
P58686 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P58686 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P58686 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
P58686 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P58686 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
P58686 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
P58686 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
P58686 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
P58686 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
P58686 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
P58686 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P58686 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P58686 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
P58686 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P58686 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P58686 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P58686 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P58686 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P58686 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P58686 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
P58686 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P58686 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P58686 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
P58686 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
P58686 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P58686 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P58686 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P58686 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
P58686 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
P58686 Spice1-201ENSMUST00000050897 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
P58686 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
P58686 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
P58686 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
P58686 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
P58686 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
P58686 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
P58686 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
P58686 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
P58686 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
P58686 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
P58686 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
P58686 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
P58686 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
P58686 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
P58686 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
P58686 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
P58686 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
P58686 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
P58686 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
P58686 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
P58686 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
P58686 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
P58686 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
P58686 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
P58686 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
P58686 Olfr311-201ENSMUST00000071625 927 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
P58686 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
P58686 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
P58686 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
P58686 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
P58686 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
P58686 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
P58686 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
P58686 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
P58686 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
P58686 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
P58686 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
P58686 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
P58686 Abca2-201ENSMUST00000102919 8033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
P58686 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
P58686 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
P58686 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
P58686 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
P58686 Gm17244-201ENSMUST00000192482 3416 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
P58686 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
P58686 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
P58686 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
P58686 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
P58686 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
P58686 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
P58686 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
P58686 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
P58686 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
P58686 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
P58686 A130071D04Rik-201ENSMUST00000194467 5864 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
P58686 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
P58686 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
P58686 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
P58686 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
P58686 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
P58686 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
P58686 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
P58686 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
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